More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3621 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3621  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 120 aa  235  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.666557  normal  0.082734 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2298  glycine cleavage system protein H  69.75 
 
 		 118 aa  174  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2194  glycine cleavage system protein H  68.91 
 
 		 118 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0869  glycine cleavage system protein H  68.91 
 
 		 118 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.731856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2392  glycine cleavage system H protein  69.75 
 
 		 119 aa  169  7.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  62.71 
 
 		 120 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2347  glycine cleavage system H protein  63.87 
 
 		 118 aa  143  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  61.06 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 122 aa  140  6e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  56.41 
 
 		 122 aa  136  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  54.7 
 
 		 120 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  56.41 
 
 		 122 aa  136  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  58.04 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  51.69 
 
 		 120 aa  134  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  56.14 
 
 		 123 aa  133  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  53.98 
 
 		 121 aa  133  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  54.46 
 
 		 121 aa  133  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  55.75 
 
 		 121 aa  133  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  53.51 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  55.75 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  54.39 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  55.08 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  50.88 
 
 		 120 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  52.14 
 
 		 124 aa  130  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  54.7 
 
 		 122 aa  130  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  53.1 
 
 		 121 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  51.75 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  52.14 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  50.83 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  53.98 
 
 		 122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3050  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 126 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  49.15 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4374  glycine cleavage system protein H  55.75 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.44648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2804  glycine cleavage system protein H  50.42 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0629199  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  51.3 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  44.92 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32985  glycine cleavage system protein H  50.42 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0356565  hitchhiker  0.0000202177 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1216  glycine cleavage system H protein  48.31 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  51.69 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  120  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1097  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  44.54 
 
 		 125 aa  120  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4391  glycine cleavage system protein H  50.42 
 
 		 127 aa  120  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175178 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  51.24 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0989  glycine cleavage system protein H  50.42 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  51.24 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2681  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.341923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  49.15 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  43.7 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  43.7 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1346  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1740  glycine cleavage system H protein  52.17 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1026  glycine cleavage system protein H  50.42 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.946369 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1937  glycine cleavage system H protein  52.17 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  49.14 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  50.43 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  45.76 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  49.56 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  49.58 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  48.76 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  47.5 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  49.58 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  47.06 
 
 		 129 aa  117  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1277  glycine cleavage system H protein  50.42 
 
 		 127 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375217  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1432  glycine cleavage system protein H  51.69 
 
 		 124 aa  117  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 		 126 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  49.58 
 
 		 129 aa  117  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4327  glycine cleavage system H protein  50.43 
 
 		 124 aa  116  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  46.09 
 
 		 134 aa  116  9e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  50.42 
 
 		 129 aa  116  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  47.5 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1738  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 122 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000301495  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 		 131 aa  115  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  58.59 
 
 		 129 aa  115  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 		 129 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  47.5 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  47.5 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  47.5 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  47.5 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>