More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1851 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 123 aa  246  9e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  68.33 
 
 		 123 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  64.23 
 
 		 123 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  66.1 
 
 		 122 aa  157  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  59.5 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  58.68 
 
 		 121 aa  153  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  60.68 
 
 		 122 aa  151  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  62.6 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  58.68 
 
 		 121 aa  151  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  57.02 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  55 
 
 		 122 aa  146  7e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  56.2 
 
 		 121 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  55 
 
 		 122 aa  146  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  57.02 
 
 		 121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  61.16 
 
 		 121 aa  145  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  62.28 
 
 		 120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1216  glycine cleavage system H protein  60.34 
 
 		 125 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  57.5 
 
 		 121 aa  140  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3050  glycine cleavage system protein H  58.68 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  57.14 
 
 		 125 aa  139  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  54.62 
 
 		 123 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  57.98 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 120 aa  137  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  56.3 
 
 		 120 aa  137  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  54.62 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  58.62 
 
 		 122 aa  136  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  58.62 
 
 		 122 aa  136  8.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  57.14 
 
 		 125 aa  136  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 120 aa  135  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4374  glycine cleavage system protein H  58.68 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.44648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  52.07 
 
 		 122 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  52.46 
 
 		 123 aa  134  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  54.62 
 
 		 124 aa  134  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0390  glycine cleavage system H protein  52.5 
 
 		 123 aa  134  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.927773 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0396  glycine cleavage system H protein  52.5 
 
 		 123 aa  134  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00460  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  53.72 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.528435  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 120 aa  133  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  54.24 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  56.3 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1937  glycine cleavage system H protein  54.17 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1740  glycine cleavage system H protein  54.17 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  53.91 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  56.9 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0533  glycine cleavage system H protein  61.17 
 
 		 121 aa  131  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4327  glycine cleavage system H protein  53.33 
 
 		 124 aa  130  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  50.82 
 
 		 124 aa  130  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1432  glycine cleavage system protein H  53.23 
 
 		 124 aa  130  9e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  52.99 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  50.85 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2681  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.341923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2673  glycine cleavage system H protein  52.5 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  52.63 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  56.3 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0376  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 124 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  52.94 
 
 		 128 aa  126  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3154  glycine cleavage system H protein  52.85 
 
 		 124 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  49.12 
 
 		 125 aa  126  8.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1738  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 122 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000301495  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2392  glycine cleavage system H protein  50.86 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4267  glycine cleavage system H protein  49.14 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.231851  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  55.56 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  44.44 
 
 		 135 aa  124  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  49.15 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3146  glycine cleavage system H protein  50.83 
 
 		 124 aa  123  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1560  glycine cleavage system H protein  51.61 
 
 		 124 aa  123  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 128 aa  123  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  46.67 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  47.01 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  55.34 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  48.28 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  51.28 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  47.86 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  50.85 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32847  glycine decarboxylase  51.28 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  46.61 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  46.61 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  47.06 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0994  glycine cleavage system protein H  52.99 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0787  glycine cleavage system H protein  51.28 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  46.61 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  53.27 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>