More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1577 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 125 aa  253  6e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1107  glycine cleavage system H protein  63.72 
 
 		 126 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0787  glycine cleavage system H protein  61.74 
 
 		 128 aa  157  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  58.62 
 
 		 127 aa  153  9e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  58.62 
 
 		 127 aa  151  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  58.73 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  57.76 
 
 		 127 aa  147  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  56.35 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  59.84 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  60 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  52.42 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  57.94 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  56 
 
 		 129 aa  139  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  52.42 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  54.76 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  53.17 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  54.76 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  54.76 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  54.76 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  54.76 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  54.4 
 
 		 129 aa  138  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  56.91 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  56.91 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  53.97 
 
 		 129 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  54.4 
 
 		 129 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  54.4 
 
 		 129 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  54.4 
 
 		 129 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  53.97 
 
 		 129 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 128 aa  135  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 128 aa  135  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  51.59 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 131 aa  134  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  53.66 
 
 		 129 aa  134  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  55.46 
 
 		 129 aa  133  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 126 aa  133  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  50.82 
 
 		 135 aa  133  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  52.42 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  54.78 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  52.38 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  52.38 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  52.94 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  52.94 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  52.94 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  52.94 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  52.94 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  52.94 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  51.59 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  45.24 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  53.54 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  53.54 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  59.05 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  52.94 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  60.16 
 
 		 126 aa  130  9e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0213  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  54.55 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  53.66 
 
 		 136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  51.2 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  46.34 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  50.42 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 135 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  59.22 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  54.1 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  52.1 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  51.28 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0177  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  52 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  47.66 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>