More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5357 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 126 aa  253  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  60.94 
 
 		 131 aa  163  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  60.94 
 
 		 131 aa  163  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  60.94 
 
 		 131 aa  163  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  60.32 
 
 		 126 aa  161  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  58.4 
 
 		 126 aa  161  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  58.4 
 
 		 126 aa  160  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  60.32 
 
 		 126 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  60.98 
 
 		 128 aa  159  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  61.11 
 
 		 126 aa  157  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  60 
 
 		 130 aa  157  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  60.48 
 
 		 133 aa  157  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  55.73 
 
 		 134 aa  157  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  58.87 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  60.98 
 
 		 131 aa  155  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  55.64 
 
 		 134 aa  154  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  58.59 
 
 		 131 aa  153  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  56.25 
 
 		 134 aa  152  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3743  glycine cleavage system H protein  53.6 
 
 		 125 aa  146  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  60 
 
 		 128 aa  146  8e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  58.82 
 
 		 127 aa  146  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  54.4 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  54.4 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  54.4 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  52.38 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  58.59 
 
 		 134 aa  143  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2340  glycine cleavage system H protein  55.81 
 
 		 134 aa  142  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 131 aa  140  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  52 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  52.8 
 
 		 127 aa  140  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  53.39 
 
 		 129 aa  137  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  52.03 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  52.85 
 
 		 126 aa  137  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 127 aa  136  7.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 130 aa  136  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  48 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  48 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  133  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 		 129 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6247  glycine cleavage system H protein  54.03 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.150459  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  51.67 
 
 		 128 aa  130  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  45.6 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  48.41 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  45.6 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 136 aa  130  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 		 125 aa  130  6.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  51.59 
 
 		 125 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  47.62 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  45.6 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  51.22 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  47.15 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  46.34 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75530  H-protein subunit of glycine cleavage system  51.35 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  48.78 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  45.6 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  45.97 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>