More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0897 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 135 aa  270  5.000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 126 aa  143  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  52.46 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  45.08 
 
 		 126 aa  140  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  49.58 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  51.16 
 
 		 129 aa  138  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  49.6 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  52.17 
 
 		 121 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 129 aa  137  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  47.11 
 
 		 127 aa  136  8.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  49.58 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  47.11 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  45.45 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  45.16 
 
 		 125 aa  134  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 125 aa  134  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  51.3 
 
 		 121 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  47.86 
 
 		 121 aa  134  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 121 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 129 aa  133  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  45.16 
 
 		 124 aa  133  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  50.44 
 
 		 125 aa  133  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  47.83 
 
 		 121 aa  133  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  50.82 
 
 		 125 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3050  glycine cleavage system protein H  47.54 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  44.8 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00460  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  46.46 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.528435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  45.76 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  47.83 
 
 		 121 aa  131  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  47.83 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  50.43 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  47.11 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  44.63 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  45.67 
 
 		 140 aa  130  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  46.77 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  44.92 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  44.92 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  45.83 
 
 		 123 aa  130  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0376  glycine cleavage system H protein  46.72 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  48.76 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  44.54 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0438  glycine cleavage system H protein  44 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  45 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  43.8 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  44.07 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  44.07 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  44.07 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  44.07 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  44.07 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  47.54 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  43.22 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  44.07 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  45.38 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  45.38 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  47.93 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  44.07 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  44.17 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  44.17 
 
 		 125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  43.33 
 
 		 134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  44.63 
 
 		 127 aa  127  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 		 131 aa  126  8.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  42.02 
 
 		 122 aa  126  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  45.38 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  44.54 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75530  H-protein subunit of glycine cleavage system  49.62 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  45.45 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2021  glycine cleavage system H protein  45 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132774  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  46.67 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 		 123 aa  124  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  46.67 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  46.15 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  46.96 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  46.61 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  47.93 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  48.33 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  47.93 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>