More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0187 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 126 aa  257  4e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  64 
 
 		 125 aa  182  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  66.67 
 
 		 126 aa  182  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  60.32 
 
 		 126 aa  173  9e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  54.33 
 
 		 127 aa  159  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  57.94 
 
 		 126 aa  159  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0030  glycine cleavage system protein H  60.32 
 
 		 126 aa  158  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166486  normal  0.0193025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  57.26 
 
 		 126 aa  157  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  58.87 
 
 		 126 aa  155  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  54.33 
 
 		 127 aa  154  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  53.23 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  52.8 
 
 		 127 aa  148  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  51.22 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  53.23 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  53.54 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 126 aa  145  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 126 aa  145  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  52.34 
 
 		 127 aa  144  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 127 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  50.79 
 
 		 126 aa  141  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1615  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  48.39 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0787  glycine cleavage system H protein  52.89 
 
 		 128 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  54.17 
 
 		 140 aa  136  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 127 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  47.54 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  47.54 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  45.45 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 		 125 aa  134  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  48 
 
 		 132 aa  134  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 127 aa  133  8e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  45.24 
 
 		 129 aa  133  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  46.61 
 
 		 126 aa  133  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  45.53 
 
 		 126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  45.83 
 
 		 128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 		 129 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0534  glycine cleavage system H protein  46.46 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  45.16 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  53.51 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  43.65 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  49.54 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  44.8 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0591  glycine cleavage system H protein  47.2 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0600985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  43.55 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 127 aa  123  9e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  48.39 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4864  glycine cleavage system H protein  41.27 
 
 		 128 aa  123  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2761  glycine cleavage system protein H  42.86 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.982317 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1732  glycine cleavage H-protein  49.6 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  45.16 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  45.6 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0363  glycine cleavage system H protein  44.8 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  45.97 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  46.46 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  47.79 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5032  glycine cleavage system protein H  43.75 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  43.51 
 
 		 134 aa  120  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  49.12 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 		 122 aa  120  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  44.8 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0605  glycine cleavage system H protein  44.17 
 
 		 132 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  43.55 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  45.6 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>