More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4450 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  100 
 
 
126 aa  253  9e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  68.8 
 
 
126 aa  176  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  66.4 
 
 
125 aa  174  5e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  60 
 
 
126 aa  170  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  60.32 
 
 
127 aa  165  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  60.8 
 
 
126 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  59.2 
 
 
126 aa  159  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  57.26 
 
 
126 aa  157  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0030  glycine cleavage system protein H  55.2 
 
 
126 aa  155  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166486  normal  0.0193025 
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  56.8 
 
 
126 aa  154  5.0000000000000005e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  57.48 
 
 
127 aa  153  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  53.54 
 
 
127 aa  151  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0534  glycine cleavage system H protein  54.33 
 
 
127 aa  150  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  56.69 
 
 
127 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  56.69 
 
 
127 aa  148  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1615  glycine cleavage system protein H  54.33 
 
 
127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1732  glycine cleavage H-protein  57.14 
 
 
125 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 
128 aa  143  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 
126 aa  142  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  50.81 
 
 
126 aa  142  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  46.72 
 
 
126 aa  140  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  45.6 
 
 
126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  45.6 
 
 
126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 
127 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0591  glycine cleavage system H protein  52.38 
 
 
126 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0600985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 
129 aa  135  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 
127 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 
140 aa  133  8e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 
127 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  46.77 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  46.34 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  46.34 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  46.34 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  46.34 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  44.35 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  44.35 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  46.34 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  46.34 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  46.34 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  46.34 
 
 
127 aa  131  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  46.34 
 
 
127 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  46.34 
 
 
127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  43.9 
 
 
127 aa  130  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  43.55 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  45.08 
 
 
125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  46.61 
 
 
129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  43.55 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 
127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  47.83 
 
 
121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  42.74 
 
 
129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  45.16 
 
 
126 aa  127  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  44.26 
 
 
130 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  44.8 
 
 
129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  47.83 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  42.4 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  41.13 
 
 
130 aa  125  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  45.54 
 
 
122 aa  124  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  44.44 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  46.61 
 
 
135 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  44.44 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0787  glycine cleavage system H protein  44.63 
 
 
128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  47.83 
 
 
121 aa  124  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  43.9 
 
 
126 aa  124  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  45.16 
 
 
127 aa  124  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  43.9 
 
 
126 aa  124  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  45.97 
 
 
130 aa  124  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  47.83 
 
 
121 aa  123  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  44 
 
 
130 aa  123  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  41.94 
 
 
132 aa  122  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  44 
 
 
127 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  45.22 
 
 
121 aa  122  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  42.74 
 
 
129 aa  122  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  42.74 
 
 
127 aa  122  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  47.54 
 
 
129 aa  122  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  44.26 
 
 
126 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  43.31 
 
 
131 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 
131 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  43.31 
 
 
131 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  46.77 
 
 
127 aa  122  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  43.2 
 
 
127 aa  122  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  43.31 
 
 
131 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  44 
 
 
127 aa  121  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  41.94 
 
 
132 aa  121  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  43.2 
 
 
133 aa  121  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  47.41 
 
 
131 aa  121  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  45.24 
 
 
126 aa  120  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  42.86 
 
 
126 aa  120  7e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  42.37 
 
 
126 aa  120  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 
123 aa  120  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  46.9 
 
 
121 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  42.4 
 
 
128 aa  120  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  43.2 
 
 
127 aa  120  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 
123 aa  120  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  41.6 
 
 
130 aa  120  9e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  43.97 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  43.9 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2021  glycine cleavage system H protein  42.74 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132774  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  43.31 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  43.65 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>