More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_75530 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_75530  H-protein subunit of glycine cleavage system  100 
 
 		 177 aa  357  7e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  52.07 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  51.35 
 
 		 126 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 		 128 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  49.62 
 
 		 135 aa  125  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 133 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  47.62 
 
 		 140 aa  125  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  54.4 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  48.82 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  51.16 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  53.15 
 
 		 126 aa  124  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 130 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 126 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  46.46 
 
 		 129 aa  123  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  123  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1432  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 124 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4327  glycine cleavage system H protein  47.93 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 		 129 aa  123  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  54.1 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 131 aa  122  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 129 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  48.82 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  48.82 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  53.33 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  51.64 
 
 		 123 aa  121  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  46.92 
 
 		 134 aa  121  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1738  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 		 122 aa  121  7e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000301495  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  47.73 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 129 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 126 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  49.54 
 
 		 130 aa  120  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 125 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  49.54 
 
 		 130 aa  120  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  50.45 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  45.67 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  55.34 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 129 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 129 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 129 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  50.42 
 
 		 122 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1107  glycine cleavage system H protein  52.83 
 
 		 126 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  49.21 
 
 		 129 aa  118  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  50.45 
 
 		 129 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3146  glycine cleavage system H protein  46.67 
 
 		 124 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  52.03 
 
 		 129 aa  118  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  46.88 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  45.67 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  45.45 
 
 		 127 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  45.45 
 
 		 127 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  45.45 
 
 		 127 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  45.45 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  45.45 
 
 		 127 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  45.45 
 
 		 127 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  45.53 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  52.73 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1591  glycine cleavage system H protein  47.15 
 
 		 124 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  45.45 
 
 		 127 aa  115  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  43.65 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  45.16 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  46.34 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  45.45 
 
 		 127 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1740  glycine cleavage system H protein  45.45 
 
 		 124 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  45.67 
 
 		 130 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  46.46 
 
 		 129 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  45.45 
 
 		 127 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  47.83 
 
 		 130 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1937  glycine cleavage system H protein  45.45 
 
 		 124 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  44.63 
 
 		 126 aa  115  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  46.46 
 
 		 126 aa  115  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  44.63 
 
 		 126 aa  115  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  44.62 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>