More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1893 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  100 
 
 
127 aa  250  5.000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  77.95 
 
 
127 aa  192  9e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  71.65 
 
 
127 aa  181  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  67.19 
 
 
128 aa  171  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  67.46 
 
 
124 aa  166  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  53.97 
 
 
129 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 
126 aa  147  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  55.91 
 
 
131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  51.64 
 
 
126 aa  144  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  54.03 
 
 
126 aa  144  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 
127 aa  142  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  54.92 
 
 
130 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 
127 aa  141  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 
127 aa  140  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
127 aa  140  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
127 aa  140  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
127 aa  140  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
127 aa  140  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
127 aa  140  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
127 aa  140  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2761  glycine cleavage system protein H  52 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.982317 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  57.14 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  54.1 
 
 
131 aa  137  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 
131 aa  138  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  57.14 
 
 
129 aa  138  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 
126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  53.72 
 
 
126 aa  137  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 
126 aa  136  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 
126 aa  136  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  47.11 
 
 
135 aa  136  8.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  53.23 
 
 
130 aa  136  8.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 
125 aa  135  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 
125 aa  135  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  53.72 
 
 
126 aa  136  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  52.46 
 
 
131 aa  136  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 
127 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  50 
 
 
129 aa  135  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17961  putative glycine cleavage H-protein  50.39 
 
 
131 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  54.03 
 
 
127 aa  135  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  50.82 
 
 
129 aa  135  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 
127 aa  135  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 
130 aa  135  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  54.03 
 
 
129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  58.26 
 
 
129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 
128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18591  glycine cleavage system protein H  44.09 
 
 
129 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 
129 aa  133  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  49.17 
 
 
128 aa  133  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 
128 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 
127 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  48.39 
 
 
126 aa  133  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  52.42 
 
 
155 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  50 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  52.42 
 
 
129 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 
133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  52.46 
 
 
128 aa  131  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18591  glycine cleavage system protein H  44.88 
 
 
129 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  53.23 
 
 
129 aa  131  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1269  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 
132 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1300  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 
132 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  51.24 
 
 
126 aa  131  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  50.81 
 
 
126 aa  131  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  52.63 
 
 
126 aa  131  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  52.42 
 
 
129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  56.07 
 
 
127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18781  glycine cleavage system protein H  44.09 
 
 
129 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 
129 aa  130  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4864  glycine cleavage system H protein  50 
 
 
128 aa  130  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3845  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 
128 aa  130  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1761  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 
129 aa  130  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 
126 aa  130  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  53.23 
 
 
126 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  53.12 
 
 
134 aa  130  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  53.23 
 
 
126 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 
129 aa  130  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  52.42 
 
 
129 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  50 
 
 
130 aa  130  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 
126 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 
130 aa  130  9e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  52.8 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  51.22 
 
 
129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 
129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 
129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 
129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  51.67 
 
 
129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 
129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 
129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 
129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 
129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  56.45 
 
 
131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 
129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 
129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>