More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2761 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2761  glycine cleavage system protein H  100 
 
 
130 aa  258  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.982317 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4864  glycine cleavage system H protein  71.43 
 
 
128 aa  194  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  69.29 
 
 
131 aa  186  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  62.99 
 
 
129 aa  184  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1269  glycine cleavage system protein H  64.06 
 
 
132 aa  177  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1300  glycine cleavage system protein H  64.06 
 
 
132 aa  177  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5032  glycine cleavage system protein H  62.31 
 
 
131 aa  172  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2046  glycine cleavage system protein H  54.4 
 
 
129 aa  154  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2539  glycine cleavage system protein H  52.8 
 
 
129 aa  152  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28911  glycine cleavage system protein H  53.12 
 
 
129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2189  glycine cleavage system protein H  53.6 
 
 
129 aa  148  3e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17961  putative glycine cleavage H-protein  44.8 
 
 
131 aa  140  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  52 
 
 
127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1268  glycine cleavage system protein H  43.31 
 
 
128 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21391  glycine cleavage system protein H  43.31 
 
 
128 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  53.17 
 
 
126 aa  133  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 
127 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 
129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 
126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  51.64 
 
 
140 aa  131  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18781  glycine cleavage system protein H  48 
 
 
129 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  50 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1761  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 
129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 
128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18591  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 
129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 
128 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  49.15 
 
 
126 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  49.15 
 
 
126 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  44.88 
 
 
126 aa  128  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 
128 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  44.44 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  46.61 
 
 
126 aa  126  9.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  51.59 
 
 
128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18591  glycine cleavage system protein H  45.6 
 
 
129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  44.53 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  47.9 
 
 
128 aa  124  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  47.06 
 
 
127 aa  123  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  46.77 
 
 
126 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  45.83 
 
 
130 aa  123  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  45.97 
 
 
126 aa  122  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  46.72 
 
 
127 aa  123  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 
126 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  42.86 
 
 
126 aa  122  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  46.62 
 
 
130 aa  121  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  48.82 
 
 
127 aa  120  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  41.09 
 
 
135 aa  120  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  46.03 
 
 
129 aa  120  6e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 
120 aa  120  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  43.22 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  44.35 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 
129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  43.9 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  45.69 
 
 
120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  47.01 
 
 
127 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  50.47 
 
 
124 aa  118  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  41.03 
 
 
128 aa  118  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  42.86 
 
 
129 aa  118  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32847  glycine decarboxylase  47.06 
 
 
157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  48.33 
 
 
126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  44 
 
 
131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  50.48 
 
 
124 aa  116  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  46.15 
 
 
127 aa  116  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
126 aa  115  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
126 aa  115  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  46.61 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  44.83 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  45.38 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  45.38 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  44.83 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  48 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  42.37 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  43.8 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  44.53 
 
 
130 aa  114  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  44.74 
 
 
126 aa  114  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  50 
 
 
127 aa  114  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  52.53 
 
 
129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  43.9 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  44.83 
 
 
123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 
127 aa  114  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 
127 aa  114  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 
127 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 
127 aa  114  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 
127 aa  114  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 
127 aa  114  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 
127 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  43.31 
 
 
130 aa  114  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  45.83 
 
 
127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 
127 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 
127 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  47.62 
 
 
129 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  49.5 
 
 
120 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  49.52 
 
 
129 aa  113  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  47.62 
 
 
129 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  40.34 
 
 
125 aa  113  8.999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  47.62 
 
 
129 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>