More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2046 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2046  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 129 aa  257  3e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  62.2 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5032  glycine cleavage system protein H  61.07 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  57.03 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1269  glycine cleavage system protein H  58.91 
 
 		 132 aa  157  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1300  glycine cleavage system protein H  58.91 
 
 		 132 aa  157  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4864  glycine cleavage system H protein  56 
 
 		 128 aa  154  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2761  glycine cleavage system protein H  54.4 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.982317 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2539  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 129 aa  145  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2189  glycine cleavage system protein H  53.97 
 
 		 129 aa  143  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28911  glycine cleavage system protein H  52.46 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17961  putative glycine cleavage H-protein  49.21 
 
 		 131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1268  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 128 aa  136  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21391  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  48.44 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18591  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 128 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18781  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  53.1 
 
 		 126 aa  130  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  48.09 
 
 		 130 aa  130  9e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  48 
 
 		 126 aa  130  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  49.6 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  48.78 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  44.72 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  47.54 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 129 aa  126  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1761  glycine cleavage system protein H  47.62 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  47.2 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18591  glycine cleavage system protein H  46.83 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  46.09 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  46.34 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  43.55 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  47.86 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  43.8 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  43.8 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  45.76 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  47.11 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  46.34 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  44.63 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  42.15 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  47.11 
 
 		 127 aa  120  7e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2352  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 		 126 aa  120  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0122881  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  46.77 
 
 		 140 aa  120  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  51.28 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  48.33 
 
 		 123 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  48.31 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  45.08 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  47.5 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  44.63 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  46.22 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  46.22 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  44.92 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  45.45 
 
 		 134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  46.15 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  48.33 
 
 		 125 aa  117  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  44.92 
 
 		 120 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  45.9 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  46.22 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  42.98 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  40.5 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0046  glycine cleavage system H protein  47.97 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517546  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  48.25 
 
 		 120 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  44.92 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  45.08 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0787  glycine cleavage system H protein  45.45 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  45.69 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  44.09 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  44.8 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  45.53 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1107  glycine cleavage system H protein  48.62 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  43.65 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  46.03 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  45.38 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  51.89 
 
 		 129 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  42.86 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 		 130 aa  113  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>