More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2189 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2189  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 129 aa  259  6.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2539  glycine cleavage system protein H  84.5 
 
 		 129 aa  224  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28911  glycine cleavage system protein H  75.4 
 
 		 129 aa  204  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1268  glycine cleavage system protein H  71.88 
 
 		 128 aa  199  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21391  glycine cleavage system protein H  71.88 
 
 		 128 aa  198  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17961  putative glycine cleavage H-protein  71.32 
 
 		 131 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2761  glycine cleavage system protein H  53.6 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.982317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 129 aa  147  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18591  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18781  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 129 aa  146  8e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1761  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  144  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18591  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  51.94 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2046  glycine cleavage system protein H  53.97 
 
 		 129 aa  143  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1300  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1269  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5032  glycine cleavage system protein H  56.64 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4864  glycine cleavage system H protein  48 
 
 		 128 aa  136  8.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  55.65 
 
 		 120 aa  133  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  53.04 
 
 		 120 aa  130  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  52.17 
 
 		 120 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  46.83 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  44 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  46.67 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  46.46 
 
 		 128 aa  123  9e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  51.3 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  45.67 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  43.55 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  50.88 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  47.9 
 
 		 128 aa  120  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  45.53 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  42.06 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5427  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.801429  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  45.67 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  43.33 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  43.09 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  45.61 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  48.31 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  45.61 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  45.9 
 
 		 127 aa  115  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  48.25 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  46.09 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 127 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 		 121 aa  114  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  42.28 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  44.26 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  40.5 
 
 		 126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  42.31 
 
 		 127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  48.7 
 
 		 142 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  45.76 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  47.27 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  41.73 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  42.15 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  42.06 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2594  glycine cleavage system H protein  48.28 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.715495  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  42.15 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  42.62 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  44.74 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  41.46 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  41.46 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  41.46 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  41.46 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  41.46 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  41.6 
 
 		 131 aa  112  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  41.94 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  46.9 
 
 		 123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  42.98 
 
 		 120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  49.12 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  37.3 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  41.46 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  41.46 
 
 		 127 aa  110  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0605  glycine cleavage system H protein  37.7 
 
 		 132 aa  110  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  41.46 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  41.46 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  44.74 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0363  glycine cleavage system H protein  37.29 
 
 		 133 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  42.86 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  37.1 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  41.46 
 
 		 127 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  40.98 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0247  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  43.22 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  43.86 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  41.54 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  41.46 
 
 		 127 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  46.61 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0317  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  44.74 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>