More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1268 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1268  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 128 aa  261  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21391  glycine cleavage system protein H  98.44 
 
 		 128 aa  258  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2539  glycine cleavage system protein H  74.22 
 
 		 129 aa  206  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2189  glycine cleavage system protein H  71.88 
 
 		 129 aa  199  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28911  glycine cleavage system protein H  70.87 
 
 		 129 aa  197  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17961  putative glycine cleavage H-protein  68.75 
 
 		 131 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18781  glycine cleavage system protein H  56.35 
 
 		 129 aa  164  5e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18591  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 		 129 aa  160  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1761  glycine cleavage system protein H  54.76 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18591  glycine cleavage system protein H  54.76 
 
 		 129 aa  160  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  46.83 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 131 aa  136  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2046  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 129 aa  136  8.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4864  glycine cleavage system H protein  50.85 
 
 		 128 aa  136  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  47.24 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2761  glycine cleavage system protein H  43.31 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.982317 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1269  glycine cleavage system protein H  45.74 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1300  glycine cleavage system protein H  45.74 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5032  glycine cleavage system protein H  51.33 
 
 		 131 aa  130  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  45.97 
 
 		 130 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  47.93 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  46.46 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  45.9 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  45.76 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  43.75 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  40.48 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  47.86 
 
 		 128 aa  120  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  42.5 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  42.15 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  42.15 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  42.15 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0363  glycine cleavage system H protein  39.2 
 
 		 133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  43.33 
 
 		 127 aa  117  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  40.98 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0605  glycine cleavage system H protein  41.13 
 
 		 132 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  40.46 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  42.06 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  43.31 
 
 		 128 aa  115  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 124 aa  115  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  46.46 
 
 		 127 aa  115  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  44.35 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  44.35 
 
 		 120 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  40.16 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  43.48 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  38.84 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  41.8 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  38.71 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2340  glycine cleavage system H protein  42.11 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5427  glycine cleavage system protein H  44.35 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.801429  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  41.27 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  36.89 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  45.76 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  42.61 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  40.32 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  37.6 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  41.6 
 
 		 131 aa  110  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  42.62 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  38.4 
 
 		 127 aa  110  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  41.74 
 
 		 122 aa  110  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  39.2 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2681  glycine cleavage system protein H  43.1 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.341923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  42.61 
 
 		 120 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  41.46 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1020  glycine cleavage system protein H  52.17 
 
 		 120 aa  109  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000891205  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  38.21 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  42.74 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  39.37 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  44.35 
 
 		 127 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  43.1 
 
 		 142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  42.98 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0247  glycine cleavage system protein H  44 
 
 		 128 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  42.24 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  42.61 
 
 		 120 aa  107  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  39.02 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  40.8 
 
 		 130 aa  107  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  41.67 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  38.71 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  38.71 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  38.21 
 
 		 128 aa  107  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  40.74 
 
 		 134 aa  107  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  41.94 
 
 		 129 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  40.32 
 
 		 130 aa  107  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  39.34 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  43.2 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  42.74 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  40.8 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  39.34 
 
 		 129 aa  105  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  40.16 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3743  glycine cleavage system H protein  42.86 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  40.16 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  40.34 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  40.34 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0177  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  42.15 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  40.16 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  40.16 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  41.13 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  40.65 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  39.23 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>