More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_28911 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_28911  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 129 aa  260  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2189  glycine cleavage system protein H  75.4 
 
 		 129 aa  204  4e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2539  glycine cleavage system protein H  75.4 
 
 		 129 aa  200  4e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1268  glycine cleavage system protein H  70.87 
 
 		 128 aa  197  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21391  glycine cleavage system protein H  70.87 
 
 		 128 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17961  putative glycine cleavage H-protein  70.08 
 
 		 131 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18781  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1761  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2761  glycine cleavage system protein H  53.12 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.982317 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18591  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 129 aa  150  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18591  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  46.03 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2046  glycine cleavage system protein H  52.46 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5032  glycine cleavage system protein H  49.62 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  49.23 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1300  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1269  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 127 aa  137  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4864  glycine cleavage system H protein  46.22 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  45.76 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  43.31 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  45 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  47.66 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  45 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  45 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  47.54 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  46.88 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  47.83 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  45.45 
 
 		 129 aa  124  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  48.7 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  48.7 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  40.98 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  45.38 
 
 		 140 aa  120  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  41.67 
 
 		 126 aa  120  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  43.8 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  40.98 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  47.83 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  44.92 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  40.98 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  49.14 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5427  glycine cleavage system protein H  47.5 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.801429  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  42.86 
 
 		 129 aa  116  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  42.62 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  42.52 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  43.31 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  41.6 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  41.8 
 
 		 128 aa  115  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  40.98 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  45.76 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  44.09 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  43.59 
 
 		 127 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  41.32 
 
 		 127 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0605  glycine cleavage system H protein  37.7 
 
 		 132 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  42.5 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 		 127 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  46.15 
 
 		 128 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  43.2 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  41.67 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  42.28 
 
 		 129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  40.83 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  45.83 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  41.67 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  46.02 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  43.8 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  40.68 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  45.16 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  40.94 
 
 		 131 aa  110  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  42.37 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  44.35 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  40.5 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  40.5 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  40.5 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  40.5 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  40.5 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  40.5 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  42.28 
 
 		 126 aa  110  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  44.92 
 
 		 135 aa  110  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  38.33 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  40.5 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  40.5 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  40.5 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  40 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  40.48 
 
 		 124 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  40.5 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  43.44 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  42.62 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  41.18 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  36 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  40.35 
 
 		 120 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  42.98 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  42.98 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  44.63 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  45 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0363  glycine cleavage system H protein  35.25 
 
 		 133 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  40.35 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  43.97 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  45.13 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>