More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2714 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 128 aa  259  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  71.54 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  63.41 
 
 		 126 aa  163  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  65.62 
 
 		 130 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  60.98 
 
 		 126 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  62.3 
 
 		 126 aa  158  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  61.79 
 
 		 126 aa  157  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  63.11 
 
 		 127 aa  155  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  58.02 
 
 		 134 aa  154  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  62.5 
 
 		 128 aa  153  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  57.94 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  58.73 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  56.8 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  56.8 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  56.8 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  56.8 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  56.8 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  56.8 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  56.8 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  56.8 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  56.8 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  56.8 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  56.8 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  56.8 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  56.8 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  56 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3743  glycine cleavage system H protein  59.83 
 
 		 125 aa  150  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  56 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  56 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  56 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  56 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  56 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  56.45 
 
 		 128 aa  148  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  55.2 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  56 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  55.2 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  55.2 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  57.26 
 
 		 133 aa  147  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  55.2 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  54.4 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  54.4 
 
 		 129 aa  146  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  57.14 
 
 		 130 aa  146  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  55.2 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  54.4 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  54.4 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  55.2 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  59.2 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  56 
 
 		 130 aa  144  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  52.8 
 
 		 129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  55.04 
 
 		 134 aa  142  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  55.38 
 
 		 134 aa  142  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  55.2 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  56.2 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  55.65 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  58.33 
 
 		 134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  53.97 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  54.4 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  54.84 
 
 		 135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  53.6 
 
 		 128 aa  137  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  53.6 
 
 		 128 aa  137  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  53.6 
 
 		 128 aa  137  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  53.6 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  52.85 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  52.85 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0177  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 		 129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  56.1 
 
 		 127 aa  133  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  54.4 
 
 		 126 aa  133  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  53.17 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0907  glycine cleavage H-protein  52.5 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  51.97 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5427  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.801429  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  54.03 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6247  glycine cleavage system H protein  57.38 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.150459  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  53.6 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  53.6 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  53.97 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  52.85 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  48 
 
 		 140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  53.45 
 
 		 142 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>