More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2727 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 134 aa  263  5.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  60.47 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  63.08 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  58.59 
 
 		 126 aa  143  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  58.91 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  64.81 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  58.78 
 
 		 129 aa  140  7e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  54.89 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  58.33 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  54.96 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  52.63 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  56.15 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  54.89 
 
 		 134 aa  134  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  50.76 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  50.76 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  50.76 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  53.54 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  55.47 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  49.24 
 
 		 127 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  53.12 
 
 		 128 aa  130  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  55.3 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  52.63 
 
 		 126 aa  130  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  51.16 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  50.76 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  52.67 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  52.34 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  53.04 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3743  glycine cleavage system H protein  54.4 
 
 		 125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  53.49 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  53.49 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  53.49 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  55.81 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  55.56 
 
 		 128 aa  127  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2340  glycine cleavage system H protein  52.67 
 
 		 134 aa  127  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  53.38 
 
 		 126 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  50.77 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  50.38 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  49.62 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  56.48 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  51.16 
 
 		 134 aa  124  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  51.94 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  51.94 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  51.13 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  51.52 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  51.13 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  48.46 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  48.46 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  54.92 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  53.17 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  46.27 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  49.62 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  48.85 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  50.38 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3846  glycine cleavage system H protein  49.62 
 
 		 129 aa  120  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  51.94 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  48.06 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  48.48 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  48.46 
 
 		 125 aa  120  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  51.79 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  46.56 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  48.06 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0247  glycine cleavage system protein H  49.22 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  49.22 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  53.92 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  47.29 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  51.35 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  49.23 
 
 		 127 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0317  glycine cleavage system H protein  48.82 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  48.85 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2046  glycine cleavage system protein H  45.45 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  45.6 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  47.29 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  46.56 
 
 		 127 aa  117  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  53.6 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  47.29 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  47.29 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  48.89 
 
 		 127 aa  117  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0132  glycine cleavage system H protein  48.06 
 
 		 153 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  52.78 
 
 		 129 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  47.29 
 
 		 129 aa  116  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  46.15 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  51.61 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  45.8 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  48.46 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  48.06 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  44.44 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  46.51 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>