More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1755 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 129 aa  253  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  74.62 
 
 		 130 aa  194  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2352  glycine cleavage system H protein  61.11 
 
 		 126 aa  158  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0122881  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0425  glycine cleavage system H protein  56.35 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  56.91 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  61.79 
 
 		 133 aa  144  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  60.16 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6247  glycine cleavage system H protein  55.47 
 
 		 127 aa  141  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.150459  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  57.94 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0095  glycine cleavage system H protein  61.16 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  54.69 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  57.14 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0536  glycine cleavage system H protein  55.47 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3846  glycine cleavage system H protein  53.6 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0046  glycine cleavage system H protein  54.03 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517546  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  62.18 
 
 		 126 aa  137  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12390  glycine cleavage system H protein  56.3 
 
 		 123 aa  136  7.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00556536  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  61.32 
 
 		 124 aa  134  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  57.14 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  56.35 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  52.31 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  53.08 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  53.08 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  53.08 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  53.08 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  53.17 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  55.81 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  54.55 
 
 		 126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  52.31 
 
 		 129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  53.6 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  52.42 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  54.76 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  54.76 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  54.76 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  52.31 
 
 		 129 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  54.69 
 
 		 131 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  56.25 
 
 		 128 aa  130  9e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  51.16 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  54.84 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  52.31 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  52.31 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  52.31 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  52.31 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  52.31 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  51.54 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  53.17 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  52.31 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  52.31 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  52.31 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  52.31 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  52.31 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  52.31 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  52.31 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  48.03 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  52.31 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  53.97 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00500  glycine cleavage system H protein  54.47 
 
 		 123 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.745408  normal  0.125042 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  55.74 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  52.38 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  52.38 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  52.38 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  52.38 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  51.54 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  52.38 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  52.38 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0907  glycine cleavage H-protein  50 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  49.62 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0132  glycine cleavage system H protein  53.17 
 
 		 153 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  52.38 
 
 		 126 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3881  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  55.93 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  55.93 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  55.93 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  49.23 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  51.59 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  51.13 
 
 		 134 aa  124  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  51.22 
 
 		 129 aa  124  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  47.66 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 131 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 130 aa  123  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  44.27 
 
 		 130 aa  123  9e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  44.27 
 
 		 130 aa  123  9e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  44.53 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  46.15 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  46.92 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  52.07 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>