More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1540 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 133 aa  266  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  93.75 
 
 		 128 aa  244  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  66.39 
 
 		 126 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  60.48 
 
 		 126 aa  157  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  63.41 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  63.11 
 
 		 126 aa  151  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  60.98 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  57.26 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  55.73 
 
 		 134 aa  147  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  58.78 
 
 		 131 aa  146  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3743  glycine cleavage system H protein  54.17 
 
 		 125 aa  144  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  61.79 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  57.72 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  56.15 
 
 		 134 aa  144  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  56.45 
 
 		 130 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  60.47 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  58.06 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  57.03 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  54.4 
 
 		 129 aa  138  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  56.15 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 		 126 aa  136  8.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 		 126 aa  136  8.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6247  glycine cleavage system H protein  54.26 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.150459  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  55.65 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  53.23 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  58.47 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  58.47 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  58.47 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00500  glycine cleavage system H protein  54.69 
 
 		 123 aa  133  9e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.745408  normal  0.125042 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  55.47 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 129 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  52.8 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  56.2 
 
 		 134 aa  131  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  50.79 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0536  glycine cleavage system H protein  55.28 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  54.69 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  55.96 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0591  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0600985 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  52 
 
 		 124 aa  127  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2352  glycine cleavage system H protein  54.47 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0122881  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  52.34 
 
 		 127 aa  127  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  46.83 
 
 		 125 aa  127  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  47.66 
 
 		 155 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0425  glycine cleavage system H protein  52.03 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  47.2 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75530  H-protein subunit of glycine cleavage system  50.41 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.508507 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  45.24 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  49.19 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  43.65 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2340  glycine cleavage system H protein  50.42 
 
 		 134 aa  124  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0534  glycine cleavage system H protein  46.03 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  48.82 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  48.44 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 130 aa  123  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  48.44 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  48.44 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  48.44 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  53.28 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  48.44 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  48.44 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  55.08 
 
 		 129 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  48.44 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>