More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0573 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 127 aa  252  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  80.16 
 
 		 127 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  76.19 
 
 		 127 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1615  glycine cleavage system protein H  73.02 
 
 		 127 aa  196  7.999999999999999e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1732  glycine cleavage H-protein  76.98 
 
 		 125 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0534  glycine cleavage system H protein  68.25 
 
 		 127 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0591  glycine cleavage system H protein  62.7 
 
 		 126 aa  168  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0600985 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  59.84 
 
 		 125 aa  158  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  55.12 
 
 		 127 aa  150  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  56.25 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  56.69 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  57.14 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  54.69 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  52.34 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  57.14 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  51.59 
 
 		 133 aa  141  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  51.56 
 
 		 127 aa  140  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  49.22 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  53.12 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 128 aa  135  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 128 aa  135  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  52.8 
 
 		 127 aa  135  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 128 aa  135  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  48.85 
 
 		 134 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0030  glycine cleavage system protein H  52.34 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166486  normal  0.0193025 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 127 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 127 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 127 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 127 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  52.85 
 
 		 127 aa  133  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 127 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 127 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 127 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  48.41 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  49.21 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  48.03 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  50.78 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  52.46 
 
 		 125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 129 aa  127  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  52.8 
 
 		 129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  48.39 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  50.79 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  46.83 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  47.62 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  49.22 
 
 		 134 aa  124  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  52.38 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  50.82 
 
 		 129 aa  123  9e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  48 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0132  glycine cleavage system H protein  49.6 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  45.24 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 126 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  44.53 
 
 		 127 aa  120  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  50.47 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 129 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  48.41 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  46.46 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  53.85 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  46.46 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  46.34 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0787  glycine cleavage system H protein  47.97 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  46.77 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  48.72 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 126 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  47.11 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  48.89 
 
 		 134 aa  117  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  46.15 
 
 		 134 aa  117  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>