More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0534 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0534  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 127 aa  253  7e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1615  glycine cleavage system protein H  69.84 
 
 		 127 aa  183  6e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  69.29 
 
 		 127 aa  183  9e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  68.25 
 
 		 127 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0591  glycine cleavage system H protein  70.08 
 
 		 126 aa  181  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0600985 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  64.57 
 
 		 127 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  60.63 
 
 		 127 aa  166  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1732  glycine cleavage H-protein  63.78 
 
 		 125 aa  158  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  57.03 
 
 		 126 aa  151  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  57.03 
 
 		 126 aa  151  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  54.33 
 
 		 126 aa  150  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  57.48 
 
 		 126 aa  150  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  54.69 
 
 		 126 aa  147  6e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  57.81 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  59.06 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  55.56 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  53.54 
 
 		 127 aa  143  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  53.54 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 127 aa  139  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  53.12 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  53.12 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  53.12 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  53.12 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  53.12 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  53.12 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  53.12 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  53.12 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  53.91 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  51.59 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  53.54 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  50.78 
 
 		 128 aa  134  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0030  glycine cleavage system protein H  55.91 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166486  normal  0.0193025 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  48.41 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  46.46 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  47.66 
 
 		 128 aa  126  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  47.66 
 
 		 128 aa  126  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  46.97 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  46.88 
 
 		 128 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  46.88 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  47.66 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  46.03 
 
 		 133 aa  124  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  48.44 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 		 129 aa  123  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  45.31 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  42.4 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  49.21 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  45.24 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  46.88 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  45.67 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  45.67 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  45.31 
 
 		 132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  50.77 
 
 		 131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  46.03 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3004  glycine cleavage system protein H  46.88 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.655553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  44.53 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3146  glycine cleavage system H protein  52.99 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  44.44 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  45.6 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  46.83 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  46.03 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  47.62 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0132  glycine cleavage system H protein  49.6 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  42.86 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  47.15 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00460  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  46.49 
 
 		 160 aa  113  7.999999999999999e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.528435  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  44.72 
 
 		 140 aa  113  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  46.46 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  47.62 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  46.83 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  45.08 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  50.43 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  43.65 
 
 		 129 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  40.94 
 
 		 130 aa  112  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  46.88 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  49.11 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  46.96 
 
 		 130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  48.31 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  53.04 
 
 		 123 aa  110  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  46.67 
 
 		 130 aa  110  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  45.6 
 
 		 129 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  45.6 
 
 		 129 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  45.6 
 
 		 129 aa  110  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  45.6 
 
 		 129 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  45.6 
 
 		 129 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  45.6 
 
 		 129 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>