More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0620 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 127 aa  253  6e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1615  glycine cleavage system protein H  80.95 
 
 		 127 aa  214  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  80.16 
 
 		 127 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  77.17 
 
 		 127 aa  205  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1732  glycine cleavage H-protein  74.8 
 
 		 125 aa  188  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0534  glycine cleavage system H protein  69.29 
 
 		 127 aa  183  9e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0591  glycine cleavage system H protein  63.78 
 
 		 126 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0600985 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  57.48 
 
 		 127 aa  156  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  59.84 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  58.59 
 
 		 126 aa  150  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  56.69 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  54.33 
 
 		 126 aa  147  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  55.56 
 
 		 126 aa  146  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  55.91 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  143  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  53.12 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  53.12 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  53.12 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  53.54 
 
 		 127 aa  140  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  56.91 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  54.33 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  49.22 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  49.22 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  47.62 
 
 		 126 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  49.22 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  49.22 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  49.22 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  53.66 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0030  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166486  normal  0.0193025 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  48.44 
 
 		 127 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  49.61 
 
 		 126 aa  133  8e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  49.24 
 
 		 134 aa  133  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  49.22 
 
 		 126 aa  133  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  48.44 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  48.44 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  48.44 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  48.44 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  48.44 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  48.44 
 
 		 127 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  48.44 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  48.44 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  48.44 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  55.86 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 130 aa  130  7.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  46.88 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  48.44 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  51.59 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  46.4 
 
 		 125 aa  127  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  52.8 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  48.39 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 129 aa  126  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  47.24 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  43.65 
 
 		 133 aa  124  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  44.44 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 131 aa  124  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  47.54 
 
 		 140 aa  124  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  48.84 
 
 		 134 aa  123  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  49.6 
 
 		 128 aa  123  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  47.66 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  48.44 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  47.2 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  46.88 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  50.38 
 
 		 134 aa  121  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  54.21 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  47.62 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2348  glycine cleavage system H protein  49.21 
 
 		 134 aa  120  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  43.75 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  47.62 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 		 130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  50.39 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  50.42 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  48.76 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  48.03 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  48.41 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  48.41 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  48.41 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  48.76 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  48.41 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  48.41 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  48.41 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  48.41 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>