More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0591 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0591  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 126 aa  254  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0600985 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0534  glycine cleavage system H protein  70.08 
 
 		 127 aa  181  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  63.78 
 
 		 127 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  62.7 
 
 		 127 aa  168  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  61.42 
 
 		 127 aa  167  6e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1615  glycine cleavage system protein H  61.9 
 
 		 127 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1732  glycine cleavage H-protein  61.11 
 
 		 125 aa  156  8e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  59.84 
 
 		 127 aa  156  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  53.54 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  53.97 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  52.38 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  52.76 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  49.21 
 
 		 127 aa  133  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  51.97 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  51.56 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 125 aa  131  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  47.62 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  47.66 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  47.66 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  48.48 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 133 aa  127  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  46.4 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  47.2 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  45.24 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  45.6 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  46.77 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  44.88 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  48.82 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  48 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  48 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  46.46 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  43.18 
 
 		 134 aa  120  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0030  glycine cleavage system protein H  47.62 
 
 		 126 aa  120  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166486  normal  0.0193025 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  45.45 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  42.52 
 
 		 132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2021  glycine cleavage system H protein  44 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132774  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  45.45 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  44.72 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  40.48 
 
 		 125 aa  117  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  45.31 
 
 		 127 aa  117  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  41.6 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 129 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 129 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  48 
 
 		 124 aa  116  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  46.03 
 
 		 126 aa  116  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  47.11 
 
 		 140 aa  115  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  53.92 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  46.72 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  46.83 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  45 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  47.54 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  42.86 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  44.35 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  44 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3743  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  44.35 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  46.83 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  43.55 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  44.26 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  44.72 
 
 		 128 aa  114  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  46.96 
 
 		 134 aa  114  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  41.6 
 
 		 128 aa  114  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  45.16 
 
 		 131 aa  113  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  45.67 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  44 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  43.65 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  42.06 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  42.06 
 
 		 129 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  42.06 
 
 		 129 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  47.37 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  41.94 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  42.06 
 
 		 129 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  42.06 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  41.94 
 
 		 136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  42.86 
 
 		 129 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  42.06 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  42.06 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  45.24 
 
 		 155 aa  110  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  42.06 
 
 		 129 aa  110  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>