More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2036 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  100 
 
 
129 aa  257  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2761  glycine cleavage system protein H  62.99 
 
 
130 aa  184  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.982317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  67.44 
 
 
131 aa  184  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1300  glycine cleavage system protein H  65.38 
 
 
132 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1269  glycine cleavage system protein H  65.38 
 
 
132 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5032  glycine cleavage system protein H  64.62 
 
 
131 aa  173  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4864  glycine cleavage system H protein  61.9 
 
 
128 aa  170  5.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2046  glycine cleavage system protein H  57.03 
 
 
129 aa  159  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2539  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  149  8.999999999999999e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  53.97 
 
 
127 aa  149  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17961  putative glycine cleavage H-protein  50 
 
 
131 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2189  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 
129 aa  147  3e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28911  glycine cleavage system protein H  46.03 
 
 
129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21391  glycine cleavage system protein H  47.62 
 
 
128 aa  144  5e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1268  glycine cleavage system protein H  46.83 
 
 
128 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  54.03 
 
 
129 aa  142  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  51.64 
 
 
126 aa  141  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  52.38 
 
 
126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  54.62 
 
 
128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  50 
 
 
126 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 
127 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 
128 aa  136  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  49.6 
 
 
126 aa  135  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  52.42 
 
 
126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  48.82 
 
 
127 aa  134  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  48.03 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 
128 aa  131  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 
126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 
126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 
126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18781  glycine cleavage system protein H  46.03 
 
 
129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1761  glycine cleavage system protein H  46.03 
 
 
129 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 
127 aa  130  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 
128 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  45.97 
 
 
126 aa  130  6.999999999999999e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 
128 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  46.77 
 
 
126 aa  130  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18591  glycine cleavage system protein H  45.24 
 
 
129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18591  glycine cleavage system protein H  46.03 
 
 
129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  45.16 
 
 
125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 
126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  45.83 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 
127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  47.54 
 
 
127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  47.54 
 
 
125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  45.45 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  45.45 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  45.16 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  49.14 
 
 
123 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  45.9 
 
 
127 aa  124  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 
127 aa  124  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2594  glycine cleavage system H protein  47.06 
 
 
128 aa  124  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.715495  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  42.4 
 
 
140 aa  123  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  47.86 
 
 
127 aa  123  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  50.88 
 
 
126 aa  122  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  43.44 
 
 
128 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00460  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  43.85 
 
 
160 aa  122  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.528435  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 
129 aa  121  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1615  glycine cleavage system protein H  44.53 
 
 
127 aa  120  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  47.5 
 
 
127 aa  120  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  45.8 
 
 
130 aa  120  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  46.72 
 
 
127 aa  120  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 
127 aa  120  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  44.8 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  47.5 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  44.83 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  46.22 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 
124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  43.9 
 
 
125 aa  118  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 
129 aa  118  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  45.6 
 
 
129 aa  118  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  48 
 
 
130 aa  118  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0030  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 
126 aa  118  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166486  normal  0.0193025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  41.13 
 
 
126 aa  118  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 
127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 
127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 
127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 
127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 
127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  43.97 
 
 
120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2348  glycine cleavage system H protein  45.08 
 
 
134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0787  glycine cleavage system H protein  48.78 
 
 
128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  45.97 
 
 
132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  47.86 
 
 
127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  43.31 
 
 
129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2681  glycine cleavage system protein H  45.69 
 
 
122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.341923  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 
127 aa  117  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2021  glycine cleavage system H protein  45.6 
 
 
128 aa  117  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 
127 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  45.61 
 
 
122 aa  117  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 
127 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 
127 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  39.34 
 
 
135 aa  116  9e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3845  glycine cleavage system H protein  47.54 
 
 
128 aa  116  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  48.33 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 
128 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>