More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN00460 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006683  CNN00460  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  100 
 
 
160 aa  326  7e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.528435  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  55.28 
 
 
123 aa  143  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  56.67 
 
 
122 aa  140  6e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01074  hypothetical glycine cleavage H-protein (Eurofung)  44.38 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.23781  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32847  glycine decarboxylase  52.34 
 
 
157 aa  135  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  54.92 
 
 
123 aa  134  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 
123 aa  134  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  46.46 
 
 
135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 
126 aa  131  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1432  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 
124 aa  131  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  49.61 
 
 
127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 
122 aa  130  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  55 
 
 
130 aa  130  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 
122 aa  130  9e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  50.82 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  46.77 
 
 
129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 
125 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1560  glycine cleavage system H protein  56.41 
 
 
124 aa  128  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  50.42 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  53.72 
 
 
130 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  51.3 
 
 
126 aa  127  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  51.3 
 
 
126 aa  127  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 
130 aa  127  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 
126 aa  127  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  50.86 
 
 
125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  53.28 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  44.26 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  53.28 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 
122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  49.15 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  48.63 
 
 
155 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  53.85 
 
 
126 aa  125  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3146  glycine cleavage system H protein  50 
 
 
124 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  47.11 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  52.94 
 
 
129 aa  124  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  52.14 
 
 
134 aa  124  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 
121 aa  124  7e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 
121 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2681  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 
122 aa  124  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.341923  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 
121 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  53.85 
 
 
123 aa  124  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  47.93 
 
 
121 aa  123  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 
127 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  46.46 
 
 
126 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4327  glycine cleavage system H protein  50 
 
 
124 aa  123  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  53.57 
 
 
126 aa  123  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  48.78 
 
 
130 aa  122  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 
124 aa  123  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 
129 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 
125 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 
125 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  54.7 
 
 
135 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3050  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 
126 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  54.7 
 
 
127 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 
131 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 
123 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1738  glycine cleavage system protein H  47.5 
 
 
122 aa  122  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000301495  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  43.85 
 
 
129 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  51.54 
 
 
130 aa  121  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  45.97 
 
 
126 aa  122  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  53.45 
 
 
130 aa  122  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 
126 aa  122  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  46.22 
 
 
128 aa  121  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  47.46 
 
 
126 aa  121  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  53.45 
 
 
121 aa  121  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
124 aa  121  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  48.78 
 
 
122 aa  121  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 
127 aa  120  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 
124 aa  120  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0533  glycine cleavage system H protein  55.14 
 
 
121 aa  120  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  47.06 
 
 
128 aa  120  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3743  glycine cleavage system H protein  49.17 
 
 
125 aa  120  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1740  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 
124 aa  120  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 
121 aa  120  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1937  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 
124 aa  120  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 
128 aa  120  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 
128 aa  120  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 
128 aa  120  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  50 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3845  glycine cleavage system H protein  48.33 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  43.44 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  47.46 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  47.46 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  47.46 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  50 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  47.46 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  47.46 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  47.46 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  47.97 
 
 
134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>