More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2055 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 127 aa  247  5e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  79.69 
 
 		 128 aa  201  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  77.95 
 
 		 127 aa  192  9e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  72.44 
 
 		 127 aa  184  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  65.08 
 
 		 124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  55 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  54.84 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  54.84 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 127 aa  140  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 127 aa  140  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 127 aa  140  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  55.65 
 
 		 129 aa  139  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 127 aa  140  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  56.45 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  60.87 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  54.1 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  54.92 
 
 		 128 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18591  glycine cleavage system protein H  45.24 
 
 		 129 aa  136  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18781  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  60 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  53.23 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1268  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  54.84 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1761  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21391  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  56.1 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17961  putative glycine cleavage H-protein  49.61 
 
 		 131 aa  133  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  54.84 
 
 		 129 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  52.76 
 
 		 127 aa  133  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  55.65 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  56.78 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  55.46 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  52.42 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  52.42 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  51.64 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  52.42 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  53.23 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  51.67 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  52.07 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0591  glycine cleavage system H protein  51.56 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0600985 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18591  glycine cleavage system protein H  42.52 
 
 		 129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  53.23 
 
 		 129 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  54.03 
 
 		 129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  51.24 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  54.03 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 133 aa  130  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  52.89 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  53.23 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  46.4 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  50.81 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2761  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.982317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  54.03 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  52.89 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  53.23 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  54.78 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  53.66 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  54.03 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  52.34 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  54.17 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  53.12 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0363  glycine cleavage system H protein  47.5 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5427  glycine cleavage system protein H  53.23 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.801429  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  50.78 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0605  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>