More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0605 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0605  glycine cleavage system H protein  100 
 
 
132 aa  268  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0363  glycine cleavage system H protein  76.34 
 
 
133 aa  216  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 
127 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  52.1 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 
127 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  52.99 
 
 
126 aa  130  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  52.63 
 
 
127 aa  130  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  46.4 
 
 
130 aa  130  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  48.74 
 
 
126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  50 
 
 
127 aa  128  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  49.17 
 
 
126 aa  127  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  51.75 
 
 
126 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  49.15 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  46.49 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  50.88 
 
 
126 aa  125  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  46.49 
 
 
128 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  45.97 
 
 
132 aa  125  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  46.49 
 
 
128 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2348  glycine cleavage system H protein  51.79 
 
 
134 aa  124  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  49.14 
 
 
126 aa  123  7e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
127 aa  122  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 
127 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 
127 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 
127 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 
127 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 
127 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  49.12 
 
 
126 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 
127 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 
127 aa  121  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 
127 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 
127 aa  121  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  49.12 
 
 
125 aa  121  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 
127 aa  120  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  44.17 
 
 
126 aa  120  5e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  45 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  48.33 
 
 
130 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  45 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  45 
 
 
132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  43.8 
 
 
127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  45 
 
 
128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  49.57 
 
 
127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 
129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  44.74 
 
 
140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  41.67 
 
 
127 aa  117  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  45.45 
 
 
134 aa  117  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  48.25 
 
 
128 aa  117  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1268  glycine cleavage system protein H  41.13 
 
 
128 aa  117  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  50.46 
 
 
129 aa  117  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  48.72 
 
 
125 aa  116  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  46.49 
 
 
128 aa  116  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  39.84 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  45.83 
 
 
126 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  44.17 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  47.5 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  43.09 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  41.32 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  45.24 
 
 
127 aa  114  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 
129 aa  114  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  46.55 
 
 
126 aa  114  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  43.7 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  40 
 
 
125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  43.7 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21391  glycine cleavage system protein H  40 
 
 
128 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  40.16 
 
 
128 aa  114  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  40 
 
 
129 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28911  glycine cleavage system protein H  37.7 
 
 
129 aa  113  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  42.5 
 
 
126 aa  113  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  37.4 
 
 
135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2539  glycine cleavage system protein H  38.33 
 
 
129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0030  glycine cleavage system protein H  48.6 
 
 
126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166486  normal  0.0193025 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  44.26 
 
 
126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  40.8 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17961  putative glycine cleavage H-protein  38.52 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  40.83 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0994  glycine cleavage system protein H  43.9 
 
 
127 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  45.61 
 
 
123 aa  111  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  44.63 
 
 
125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  44.63 
 
 
125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2761  glycine cleavage system protein H  40.34 
 
 
130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.982317 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18591  glycine cleavage system protein H  41.8 
 
 
129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  41.94 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2189  glycine cleavage system protein H  37.7 
 
 
129 aa  110  5e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  45.9 
 
 
129 aa  110  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18781  glycine cleavage system protein H  41.8 
 
 
129 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  42.15 
 
 
127 aa  110  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  43.7 
 
 
134 aa  110  8.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  46.22 
 
 
126 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  45 
 
 
131 aa  110  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  43.48 
 
 
126 aa  110  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  45.3 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0989  glycine cleavage system protein H  42.28 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236065  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1300  glycine cleavage system protein H  39.37 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  45.76 
 
 
129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2681  glycine cleavage system protein H  46.15 
 
 
122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.341923  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  38.84 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  42.5 
 
 
127 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1269  glycine cleavage system protein H  39.37 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>