More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1467 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 126 aa  253  9e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  73.81 
 
 		 126 aa  191  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  65.57 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  61.11 
 
 		 126 aa  157  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  62.3 
 
 		 128 aa  158  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  65.85 
 
 		 126 aa  157  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  57.26 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  54.4 
 
 		 126 aa  150  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  53.23 
 
 		 126 aa  150  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  54.84 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  54.1 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  61.42 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  55.64 
 
 		 134 aa  147  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  54.4 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  61.6 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  57.63 
 
 		 126 aa  145  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  61.74 
 
 		 134 aa  144  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  54.03 
 
 		 128 aa  143  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  54.84 
 
 		 128 aa  143  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  55.28 
 
 		 126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  54.03 
 
 		 128 aa  143  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  54.76 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  58.06 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  64.81 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  56.35 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  57.02 
 
 		 127 aa  141  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3743  glycine cleavage system H protein  58.82 
 
 		 125 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 125 aa  140  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  52.03 
 
 		 127 aa  140  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  54.84 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  58.59 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  52.42 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  55.83 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  56.45 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  55.2 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  53.17 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 		 127 aa  137  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  49.57 
 
 		 126 aa  137  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 		 127 aa  136  7.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  51.61 
 
 		 127 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  52.89 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  57.48 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  57.48 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  54.62 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  57.48 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  51.64 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  48.78 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  57.14 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  54.24 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 128 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  52.42 
 
 		 127 aa  133  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  46.77 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  46.61 
 
 		 126 aa  133  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2539  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  50.82 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  49.21 
 
 		 125 aa  131  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  53.23 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  44.72 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2046  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  44.63 
 
 		 135 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  57.28 
 
 		 124 aa  130  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 130 aa  129  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  45.76 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4864  glycine cleavage system H protein  47.46 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  48.78 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0536  glycine cleavage system H protein  57.26 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2761  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.982317 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  46.77 
 
 		 132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  48.28 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2352  glycine cleavage system H protein  53.78 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0122881  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0591  glycine cleavage system H protein  46.4 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0600985 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  48.76 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  45.6 
 
 		 129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>