More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0536 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0536  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 127 aa  246  8e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  80.31 
 
 		 127 aa  201  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0095  glycine cleavage system H protein  66.38 
 
 		 123 aa  155  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  60 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00500  glycine cleavage system H protein  60.48 
 
 		 123 aa  150  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.745408  normal  0.125042 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0046  glycine cleavage system H protein  60.33 
 
 		 122 aa  149  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517546  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2352  glycine cleavage system H protein  62.1 
 
 		 126 aa  147  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0122881  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  60.77 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6247  glycine cleavage system H protein  55.56 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.150459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  55.47 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0425  glycine cleavage system H protein  58.87 
 
 		 126 aa  137  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  57.8 
 
 		 124 aa  133  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3846  glycine cleavage system H protein  60.33 
 
 		 129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  56 
 
 		 128 aa  130  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1906  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 120 aa  130  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0411351 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  56.07 
 
 		 134 aa  129  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  54.47 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  55.28 
 
 		 133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  52.34 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  51.97 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12390  glycine cleavage system H protein  55.83 
 
 		 123 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00556536  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  49.57 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  59.22 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  49.57 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  55.37 
 
 		 128 aa  126  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  49.56 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  55.17 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  49.56 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  54.31 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  47.32 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  54.24 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  53.33 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  52.5 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 123 aa  120  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  45.9 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  45.9 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  48.33 
 
 		 126 aa  120  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  46.4 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  51.92 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  51.89 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  50.85 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  52.89 
 
 		 126 aa  117  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  52.29 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  49.06 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  45.9 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3146  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1432  glycine cleavage system protein H  49.14 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1740  glycine cleavage system H protein  48.11 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  49.06 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1937  glycine cleavage system H protein  48.11 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3958  glycine cleavage system H protein  49.14 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0639572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  49.02 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75530  H-protein subunit of glycine cleavage system  47.11 
 
 		 177 aa  114  3.9999999999999997e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>