More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2352 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2352  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 126 aa  250  5.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0122881  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0425  glycine cleavage system H protein  66.4 
 
 		 126 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  61.11 
 
 		 129 aa  158  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  60 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  62.9 
 
 		 127 aa  147  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  59.35 
 
 		 127 aa  147  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0536  glycine cleavage system H protein  62.1 
 
 		 127 aa  147  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3846  glycine cleavage system H protein  56.69 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  62.26 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0095  glycine cleavage system H protein  62.5 
 
 		 123 aa  135  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  56.91 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6247  glycine cleavage system H protein  56.45 
 
 		 127 aa  133  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.150459  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12390  glycine cleavage system H protein  51.22 
 
 		 123 aa  132  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00556536  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  56.8 
 
 		 126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0046  glycine cleavage system H protein  55.74 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517546  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  56.8 
 
 		 126 aa  130  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  53.78 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  54.47 
 
 		 133 aa  127  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  48.44 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  43.9 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  48.41 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  46.83 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00500  glycine cleavage system H protein  56.41 
 
 		 123 aa  123  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.745408  normal  0.125042 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  52.03 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  53.78 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 129 aa  123  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 125 aa  123  8.000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  50.39 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  47.62 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  52.34 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  49.22 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2046  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  120  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  46.46 
 
 		 130 aa  120  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 127 aa  120  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 120 aa  120  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  59.22 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  46.4 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  47.15 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  45.45 
 
 		 135 aa  117  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  49.58 
 
 		 120 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  46.46 
 
 		 130 aa  117  7.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  46.34 
 
 		 129 aa  117  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  47.62 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  46.77 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  50.96 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  50.89 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  46.46 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  54.37 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  53.27 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  47.9 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  48.33 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  52.53 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 		 122 aa  114  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  45.67 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  54.37 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  54.37 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  47.06 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  52.88 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  54.37 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  47.46 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  52.88 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  54.37 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>