More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1915 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  100 
 
 
124 aa  244  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  63.33 
 
 
127 aa  158  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0425  glycine cleavage system H protein  57.6 
 
 
126 aa  153  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283149  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2352  glycine cleavage system H protein  58.4 
 
 
126 aa  148  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0122881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  60.32 
 
 
129 aa  147  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0536  glycine cleavage system H protein  57.26 
 
 
127 aa  144  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  60.83 
 
 
126 aa  144  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  56 
 
 
130 aa  141  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0046  glycine cleavage system H protein  60.5 
 
 
122 aa  141  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517546  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00500  glycine cleavage system H protein  59.32 
 
 
123 aa  140  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.745408  normal  0.125042 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0095  glycine cleavage system H protein  61.34 
 
 
123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6247  glycine cleavage system H protein  57.72 
 
 
127 aa  137  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.150459  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  52.38 
 
 
126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  53.85 
 
 
134 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  58.12 
 
 
126 aa  137  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  54.31 
 
 
126 aa  137  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  55.2 
 
 
134 aa  137  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 
128 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  58.4 
 
 
131 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  54.03 
 
 
127 aa  135  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  52.03 
 
 
128 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  52.03 
 
 
128 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 
131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 
131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 
131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  57.76 
 
 
120 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  57.6 
 
 
126 aa  133  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  56.56 
 
 
131 aa  133  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  54.62 
 
 
134 aa  133  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3743  glycine cleavage system H protein  56.67 
 
 
125 aa  132  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  54.4 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 
126 aa  131  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2340  glycine cleavage system H protein  51.16 
 
 
134 aa  131  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 
127 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  47.24 
 
 
130 aa  130  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  50.79 
 
 
126 aa  130  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 
127 aa  129  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  53.66 
 
 
129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  48 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  53.72 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  55.28 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  53.12 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  49.62 
 
 
134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 
122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  54.76 
 
 
126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  47.24 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 
129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 
125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 
120 aa  128  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  53.17 
 
 
128 aa  127  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  45.53 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  45.53 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 
129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  52.46 
 
 
128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  48 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  43.9 
 
 
126 aa  127  6e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  54.31 
 
 
120 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  53.64 
 
 
130 aa  126  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 
127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 
120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 
126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  47.97 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  45.83 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  44.72 
 
 
126 aa  125  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 
127 aa  124  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 
127 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0787  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 
128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  51.28 
 
 
121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  52.14 
 
 
121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  50 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  53.98 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  52.14 
 
 
123 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  45.6 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  48 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 
136 aa  124  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  51.28 
 
 
121 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 
127 aa  124  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  55.28 
 
 
127 aa  124  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 
127 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  53.51 
 
 
120 aa  123  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 
127 aa  123  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  45.6 
 
 
127 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  49.22 
 
 
129 aa  123  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  49.22 
 
 
129 aa  123  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 
130 aa  123  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  49.22 
 
 
129 aa  123  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  49.22 
 
 
129 aa  123  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>