More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4466 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 126 aa  254  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  65.08 
 
 		 126 aa  183  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  68 
 
 		 126 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  61.42 
 
 		 127 aa  173  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  64 
 
 		 126 aa  170  5.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0030  glycine cleavage system protein H  62.7 
 
 		 126 aa  168  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166486  normal  0.0193025 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  61.6 
 
 		 125 aa  167  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  60.8 
 
 		 126 aa  164  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  58.73 
 
 		 126 aa  164  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  57.94 
 
 		 126 aa  159  9e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  57.48 
 
 		 127 aa  158  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  56.2 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  54.76 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1615  glycine cleavage system protein H  58.27 
 
 		 127 aa  149  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  52.03 
 
 		 125 aa  148  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 		 126 aa  147  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  53.23 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 126 aa  143  9e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 132 aa  143  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 126 aa  143  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 126 aa  143  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  54.33 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0534  glycine cleavage system H protein  53.54 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 		 128 aa  140  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  54.33 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  55.28 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  52 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  52 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 		 132 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 129 aa  137  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  53.12 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  135  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  54.4 
 
 		 127 aa  135  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  51.22 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  48.39 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  53.72 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  55 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 127 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1732  glycine cleavage H-protein  51.59 
 
 		 125 aa  133  8e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  45.97 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  49.57 
 
 		 123 aa  132  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  48 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  46.77 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 127 aa  130  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  45.97 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  46.61 
 
 		 122 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 126 aa  129  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0591  glycine cleavage system H protein  47.62 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0600985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  48.72 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  49.6 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  45.76 
 
 		 122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  51.33 
 
 		 121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  55.24 
 
 		 134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  45.83 
 
 		 125 aa  127  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 130 aa  127  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 126 aa  126  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  45.45 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0177  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  47.15 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  50.88 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  47.2 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  45.3 
 
 		 123 aa  123  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  48.7 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  45.38 
 
 		 120 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  47.97 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  49.14 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1738  glycine cleavage system protein H  46.15 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000301495  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2021  glycine cleavage system H protein  45.16 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>