More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2776 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 134 aa  266  8e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2340  glycine cleavage system H protein  62.5 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  59.54 
 
 		 134 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  62.02 
 
 		 131 aa  160  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  62.02 
 
 		 131 aa  160  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  62.02 
 
 		 131 aa  160  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  63.49 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  61.24 
 
 		 131 aa  159  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  60.45 
 
 		 134 aa  158  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  60.47 
 
 		 126 aa  156  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  60.47 
 
 		 126 aa  154  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  56.25 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  57.94 
 
 		 126 aa  151  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  58.73 
 
 		 128 aa  145  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  61.79 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  61.74 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  55.47 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  55.04 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  55.91 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  59.06 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  51.94 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  52.34 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  52.34 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  52.71 
 
 		 135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  51.16 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  54.89 
 
 		 134 aa  134  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  49.62 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  56.2 
 
 		 133 aa  131  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  50.77 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  51.54 
 
 		 128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  52.71 
 
 		 128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  53.12 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  49.23 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  47.69 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  46.92 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  46.92 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  46.92 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  49.23 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  46.92 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  48.09 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  46.92 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  46.92 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  59.43 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  46.92 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3743  glycine cleavage system H protein  55.26 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  46.92 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  46.92 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  49.23 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  46.92 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  46.92 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  46.92 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  49.23 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  46.92 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  51.94 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  53.12 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  49.23 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  49.23 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  51.56 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  49.23 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  49.23 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  49.23 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  49.23 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  47.29 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  46.15 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  46.56 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  55.17 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  45.67 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  49.07 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  45.67 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  49.23 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  46.15 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00500  glycine cleavage system H protein  57.55 
 
 		 123 aa  123  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.745408  normal  0.125042 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  48.46 
 
 		 129 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  48.84 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  47.37 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  45.52 
 
 		 135 aa  122  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  51.16 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  47.69 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  47.66 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  46.15 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  48.06 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  48.72 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  48.06 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  48.44 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  44.19 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>