More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2594 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2594  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 128 aa  260  4.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.715495  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 122 aa  133  8e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  52.03 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 122 aa  130  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  51.22 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  45.45 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  47.06 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  49.14 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  48.25 
 
 		 125 aa  123  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  47.01 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0213  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 129 aa  120  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  49.14 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  51.75 
 
 		 120 aa  120  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  45.45 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  47.11 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  47.58 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  49.12 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  48.33 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  46.22 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  46.55 
 
 		 130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  45.38 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  47.41 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  45.83 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  49.12 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  47.06 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  51.33 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  49.12 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  49.12 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  46.61 
 
 		 123 aa  117  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  44.8 
 
 		 129 aa  117  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  47.41 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  42.98 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  45.31 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  45.24 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  43.09 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32847  glycine decarboxylase  43.8 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  47.06 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  46.61 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  46.61 
 
 		 134 aa  115  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1269  glycine cleavage system protein H  41.8 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1300  glycine cleavage system protein H  41.8 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  45.45 
 
 		 128 aa  114  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  45.3 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  47.83 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  47.06 
 
 		 123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  44.35 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  45.61 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  45.61 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  49.09 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  47.41 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  46.72 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  46.72 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  45.61 
 
 		 124 aa  114  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  46.09 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  43.97 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  44.74 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  45.16 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  44.35 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  46.67 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 		 127 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  39.02 
 
 		 125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  46.61 
 
 		 135 aa  113  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  46.61 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  45.08 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  42.28 
 
 		 135 aa  113  7.999999999999999e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0247  glycine cleavage system protein H  49.58 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 		 127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 		 130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  47.46 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  45.69 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 		 130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  45.16 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  45.08 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  48.7 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  44.17 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  45.69 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4864  glycine cleavage system H protein  42.98 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  45.16 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  47.46 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>