More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0050 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 124 aa  249  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  58.82 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  56.45 
 
 		 125 aa  145  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  60 
 
 		 121 aa  144  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  53.28 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  57.14 
 
 		 121 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 122 aa  140  7e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  55.93 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  59.48 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  52.99 
 
 		 121 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  55 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  55 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  59.48 
 
 		 120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 121 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  53.23 
 
 		 124 aa  137  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  54.55 
 
 		 123 aa  137  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  57.63 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  53.78 
 
 		 121 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  58.62 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  55.37 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  53.45 
 
 		 123 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  55.37 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  56.9 
 
 		 120 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  55.37 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  55.37 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 		 120 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  52.99 
 
 		 121 aa  134  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 123 aa  134  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3050  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 125 aa  133  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  45.16 
 
 		 135 aa  133  8e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 129 aa  133  8e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  47.93 
 
 		 125 aa  132  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  54.55 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  54.55 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  54.55 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  54.55 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  57.76 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  54.55 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1216  glycine cleavage system H protein  53.23 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705649 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  50.83 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  50.83 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  55.08 
 
 		 129 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  47.86 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  55 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 122 aa  130  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 122 aa  130  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 122 aa  130  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32847  glycine decarboxylase  53.04 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 129 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  44.07 
 
 		 125 aa  130  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  52.94 
 
 		 127 aa  129  9e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  130  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 		 129 aa  129  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  54.17 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  54.17 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  53.39 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3621  glycine cleavage system protein H  51.75 
 
 		 120 aa  128  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.666557  normal  0.082734 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  54.17 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2673  glycine cleavage system H protein  48.39 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  51.69 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  48.7 
 
 		 134 aa  127  7.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  55.93 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4374  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 121 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.44648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3154  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 		 124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  43.33 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2464  glycine cleavage system H protein  58.93 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239557  normal  0.657503 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2298  glycine cleavage system protein H  47.86 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 126 aa  124  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 135 aa  124  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0376  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 		 124 aa  123  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  47.5 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  56.03 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2194  glycine cleavage system protein H  47.86 
 
 		 118 aa  123  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 124 aa  123  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0869  glycine cleavage system protein H  47.86 
 
 		 118 aa  123  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.731856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>