More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2673 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2673  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 124 aa  247  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3154  glycine cleavage system H protein  66.39 
 
 		 124 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0338  glycine cleavage system H protein  64.52 
 
 		 125 aa  165  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0357579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0376  glycine cleavage system H protein  64.75 
 
 		 124 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1591  glycine cleavage system H protein  66.13 
 
 		 124 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0390  glycine cleavage system H protein  63.33 
 
 		 123 aa  157  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.927773 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0396  glycine cleavage system H protein  62.5 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  52.07 
 
 		 121 aa  136  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  52.42 
 
 		 125 aa  133  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 125 aa  130  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 124 aa  130  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  48.39 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 123 aa  128  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  52.59 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  52.14 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  47.01 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1738  glycine cleavage system protein H  48.31 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000301495  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  48.28 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  44.17 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 123 aa  124  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  44.17 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  49.11 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  44.17 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  44.17 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  45.45 
 
 		 122 aa  120  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 		 129 aa  120  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  47.06 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  46.96 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0244  glycine cleavage system H protein  50.47 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  46.09 
 
 		 122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1216  glycine cleavage system H protein  46.77 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705649 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  47.5 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  44.54 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  46.09 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  47.5 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  39.52 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  45 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  44.63 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  44.63 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  46.22 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  46.22 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  46.22 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  40.83 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  46.55 
 
 		 130 aa  116  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32847  glycine decarboxylase  45.61 
 
 		 157 aa  116  9e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  45.76 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  49.57 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  44.92 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  44.92 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  45.9 
 
 		 127 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  41.8 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  48.72 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  44.54 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  43.59 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2392  glycine cleavage system H protein  46.55 
 
 		 119 aa  114  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  43.1 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3050  glycine cleavage system protein H  44 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  41.53 
 
 		 126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  43.7 
 
 		 129 aa  113  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2836  glycine cleavage system H protein  45.3 
 
 		 120 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136421  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  45.22 
 
 		 121 aa  113  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  45.83 
 
 		 123 aa  113  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0213  glycine cleavage system protein H  44.72 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  45.61 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0764  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  42.74 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  46.23 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1560  glycine cleavage system H protein  45.83 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  41.32 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0132  glycine cleavage system H protein  46.15 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  46.09 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  44.92 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  48.08 
 
 		 127 aa  110  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  37.19 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  42.37 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  44.17 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  47.06 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  45.45 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  45.3 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4374  glycine cleavage system protein H  48.33 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.44648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>