More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_32847 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_32847  glycine decarboxylase  100 
 
 		 157 aa  320  3e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 121 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  56.14 
 
 		 122 aa  136  8.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  50.42 
 
 		 126 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 122 aa  136  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00460  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  52.34 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.528435  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  53.1 
 
 		 134 aa  134  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  50.88 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  51.75 
 
 		 126 aa  133  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  51.75 
 
 		 126 aa  133  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  52.63 
 
 		 125 aa  132  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 		 121 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 123 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  53.04 
 
 		 124 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4374  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.44648  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  49.14 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  48.33 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 123 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  47.86 
 
 		 124 aa  127  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  50.88 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  51.79 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3050  glycine cleavage system protein H  53.51 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  51.75 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  48.33 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  46.49 
 
 		 125 aa  125  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  48.72 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  52.17 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  49.17 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  52.17 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  47.41 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 125 aa  124  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  50.88 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  50.88 
 
 		 127 aa  124  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  50.88 
 
 		 127 aa  124  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  47.06 
 
 		 126 aa  124  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  50.88 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  50.88 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  50.88 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  50.88 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  50.88 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  49.15 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  49.15 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  47.86 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  50.88 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4864  glycine cleavage system H protein  47.9 
 
 		 128 aa  122  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  49.15 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  48.31 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  48.67 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  44.07 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  51.75 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  51.28 
 
 		 123 aa  121  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1982  glycine cleavage system H protein  47.5 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0297807  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  48.7 
 
 		 122 aa  120  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  46.22 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 		 126 aa  120  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  45.9 
 
 		 131 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  39.83 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1738  glycine cleavage system protein H  45.83 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000301495  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01656  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.671039  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  50.44 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0244  glycine cleavage system H protein  46.73 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  44.26 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  49.56 
 
 		 122 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  47.06 
 
 		 127 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2761  glycine cleavage system protein H  47.06 
 
 		 130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.982317 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0764  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  43.8 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  47.32 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 		 127 aa  117  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 123 aa  117  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2673  glycine cleavage system H protein  45.61 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  47.37 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  48.33 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0390  glycine cleavage system H protein  45.45 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.927773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  46.49 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  50.88 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2594  glycine cleavage system H protein  43.8 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.715495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  44.63 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  45.45 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  46.22 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  52.34 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3845  glycine cleavage system H protein  47.5 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1560  glycine cleavage system H protein  51.33 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0396  glycine cleavage system H protein  44.63 
 
 		 123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3621  glycine cleavage system protein H  48.25 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.666557  normal  0.082734 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  49.14 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0376  glycine cleavage system H protein  43.22 
 
 		 124 aa  114  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1432  glycine cleavage system protein H  48.72 
 
 		 124 aa  114  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>