More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0447 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 126 aa  253  6e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  59.83 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  59.17 
 
 		 124 aa  150  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  54.47 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  58.62 
 
 		 123 aa  148  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  57.72 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  57.72 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  55.93 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  53.33 
 
 		 123 aa  143  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  53.72 
 
 		 134 aa  143  8.000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  56.1 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 135 aa  143  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 121 aa  141  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  57.38 
 
 		 129 aa  140  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  47.15 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 120 aa  140  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  53.78 
 
 		 125 aa  139  9e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  52.14 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  51.28 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  52.59 
 
 		 123 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  53.72 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  51.69 
 
 		 121 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  49.58 
 
 		 120 aa  137  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  51.28 
 
 		 125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 121 aa  137  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  51.22 
 
 		 126 aa  137  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  52.03 
 
 		 135 aa  136  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  52.03 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 125 aa  136  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  52.03 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  48.31 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  49.58 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 120 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1740  glycine cleavage system H protein  55.83 
 
 		 124 aa  134  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1937  glycine cleavage system H protein  55.83 
 
 		 124 aa  134  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  52.14 
 
 		 121 aa  133  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3146  glycine cleavage system H protein  56.78 
 
 		 124 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1560  glycine cleavage system H protein  56.14 
 
 		 124 aa  133  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1662  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 135 aa  133  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.293907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  49.14 
 
 		 123 aa  132  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  52.03 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  52.42 
 
 		 130 aa  131  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  51.22 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  51.33 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  47.11 
 
 		 125 aa  131  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  56.2 
 
 		 129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  47.86 
 
 		 124 aa  130  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  52.46 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  46.61 
 
 		 121 aa  130  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  52.46 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3050  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  52.46 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  53.66 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  45.97 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  53.66 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1432  glycine cleavage system protein H  55.26 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  56.78 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>