More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1662 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1662  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 135 aa  267  5e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.293907  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1901  glycine cleavage system H protein  64.71 
 
 		 137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119893  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  50.43 
 
 		 126 aa  133  9e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  58.04 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  51.22 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  54.78 
 
 		 125 aa  130  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  56.14 
 
 		 122 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  54.31 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  54.39 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 120 aa  127  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1107  glycine cleavage system H protein  57.43 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  46.77 
 
 		 126 aa  124  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  45.45 
 
 		 125 aa  123  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  52.59 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  53.47 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  47.83 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  50.43 
 
 		 129 aa  120  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  47.06 
 
 		 128 aa  120  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  45.6 
 
 		 127 aa  120  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  45.53 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  49.12 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  51.3 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 131 aa  120  7e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  47.15 
 
 		 130 aa  120  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  50.89 
 
 		 123 aa  120  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  45.38 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 		 131 aa  120  9e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  45.3 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  48.25 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  48.33 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  49.15 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1906  glycine cleavage system protein H  52.59 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0411351 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  46.61 
 
 		 123 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  48.67 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  44.07 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 		 130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  45.69 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  45.08 
 
 		 126 aa  116  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 128 aa  116  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  49.12 
 
 		 134 aa  116  9e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  44 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  46.49 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1560  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  45 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  44.72 
 
 		 125 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  47.62 
 
 		 130 aa  115  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  48.15 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  45.9 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  42.98 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  48.72 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  47.54 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  44.8 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 135 aa  114  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  51.89 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  42.37 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  44.54 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  47.32 
 
 		 124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  44.92 
 
 		 120 aa  113  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1738  glycine cleavage system protein H  51.79 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000301495  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0764  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 127 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 142 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  44 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  49.58 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  43.86 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>