More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1732 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1732  glycine cleavage H-protein  100 
 
 
125 aa  253  5e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  79.53 
 
 
127 aa  197  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  74.8 
 
 
127 aa  188  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  76.98 
 
 
127 aa  188  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1615  glycine cleavage system protein H  76.19 
 
 
127 aa  187  4e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0534  glycine cleavage system H protein  63.78 
 
 
127 aa  158  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0591  glycine cleavage system H protein  61.11 
 
 
126 aa  156  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0600985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  60.32 
 
 
126 aa  146  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0213  glycine cleavage system protein H  56.45 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  57.14 
 
 
126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  58.4 
 
 
126 aa  144  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  59.06 
 
 
126 aa  143  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  57.14 
 
 
125 aa  140  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  55.74 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0177  glycine cleavage system protein H  54.84 
 
 
129 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 
127 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  51.59 
 
 
127 aa  136  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  55.12 
 
 
127 aa  136  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 
127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  51.59 
 
 
126 aa  133  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 
127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
128 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
128 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  55.2 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  48.48 
 
 
134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 
126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  51.2 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 
127 aa  128  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  49.22 
 
 
128 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 
127 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 
126 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0132  glycine cleavage system H protein  52.46 
 
 
153 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 
126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 
126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 
126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 
126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 
126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5427  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.801429  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 
126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 
126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  48.78 
 
 
130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
127 aa  127  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3004  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 
126 aa  127  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.655553 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 
127 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 
127 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 
127 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 
127 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 
127 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  49.61 
 
 
130 aa  127  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  46.46 
 
 
126 aa  126  9.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  48 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  51.22 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 
129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3488  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 
130 aa  124  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  49.21 
 
 
126 aa  124  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  51.22 
 
 
131 aa  123  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0030  glycine cleavage system protein H  53.97 
 
 
126 aa  122  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166486  normal  0.0193025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3161  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 
126 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  49.6 
 
 
126 aa  122  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  48.03 
 
 
128 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  121  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3294  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 
127 aa  120  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  45.97 
 
 
125 aa  120  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 
126 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1055  glycine cleavage system H protein  48.74 
 
 
131 aa  120  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.206037  normal  0.46199 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 
126 aa  120  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 
126 aa  120  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  48.7 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  46.46 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  43.2 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  45.31 
 
 
134 aa  118  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3206  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 
128 aa  118  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000136098  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  43.65 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3881  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 
126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  47.2 
 
 
127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 
127 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  47.62 
 
 
128 aa  117  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  44 
 
 
130 aa  117  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  46.72 
 
 
126 aa  117  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0247  glycine cleavage system protein H  46.03 
 
 
128 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 
130 aa  116  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  50.43 
 
 
129 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 
133 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>