More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3846 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3846  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 129 aa  256  9e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  58.27 
 
 		 127 aa  150  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  60 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0425  glycine cleavage system H protein  55.91 
 
 		 126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2352  glycine cleavage system H protein  56.69 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0122881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  53.6 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  59.35 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0536  glycine cleavage system H protein  60.33 
 
 		 127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  51.97 
 
 		 126 aa  130  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0046  glycine cleavage system H protein  53.97 
 
 		 122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517546  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  49.61 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 		 126 aa  124  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  49.22 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  45.45 
 
 		 129 aa  123  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  49.23 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  51.18 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  51.18 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  49.62 
 
 		 134 aa  120  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0095  glycine cleavage system H protein  52.03 
 
 		 123 aa  120  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 		 129 aa  120  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  52 
 
 		 128 aa  120  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6247  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.150459  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  47.62 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  48.82 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12390  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00556536  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  49.61 
 
 		 130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  52.42 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  46.51 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  46.51 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  46.51 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  46.51 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  46.51 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  46.51 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  46.51 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  46.51 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  46.51 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  46.51 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  46.51 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  46.51 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  46.51 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  46.51 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  50.38 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  43.41 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 127 aa  116  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 127 aa  116  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 127 aa  116  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  48.82 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  46.46 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  45.74 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  48.82 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  48.82 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  48.82 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  45.74 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  46.88 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  48.82 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  45.74 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  45.74 
 
 		 129 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  49.61 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  45.74 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  48.82 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  45.67 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  48.82 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  45.74 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  45.74 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  45.74 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  48.03 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  47.66 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  47.66 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3743  glycine cleavage system H protein  47.29 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  45.74 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  45.74 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  44.62 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  48.44 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  43.41 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  44.53 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  47.66 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  47.66 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  48.82 
 
 		 128 aa  114  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  42.64 
 
 		 129 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  48.44 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  42.64 
 
 		 129 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  45.38 
 
 		 127 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  47.54 
 
 		 129 aa  113  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  44.53 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  44.7 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  45.24 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3881  glycine cleavage system protein H  46.09 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  44.88 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  45.31 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  42.11 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  40.6 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>