More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0425 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0425  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 126 aa  246  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2352  glycine cleavage system H protein  66.4 
 
 		 126 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0122881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  56.35 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  60.48 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  56.8 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  60.38 
 
 		 124 aa  144  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3846  glycine cleavage system H protein  55.91 
 
 		 129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  54.47 
 
 		 127 aa  139  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0536  glycine cleavage system H protein  58.87 
 
 		 127 aa  137  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12390  glycine cleavage system H protein  54.62 
 
 		 123 aa  135  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00556536  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  57.6 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3743  glycine cleavage system H protein  53.97 
 
 		 125 aa  131  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  49.22 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  52.34 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  46.88 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  50.78 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  51.22 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 135 aa  127  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  52.71 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  51.59 
 
 		 130 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  52.03 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6247  glycine cleavage system H protein  54.03 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.150459  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0095  glycine cleavage system H protein  56.3 
 
 		 123 aa  124  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 136 aa  124  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  45.53 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  52 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  52.8 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  53.27 
 
 		 130 aa  123  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 122 aa  123  9e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  49.21 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  49.15 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  44 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  52.99 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  46.61 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  48.76 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  48.41 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  52.46 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1906  glycine cleavage system protein H  51.69 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0411351 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0787  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  48.03 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  48.03 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>