More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0766 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 127 aa  251  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0536  glycine cleavage system H protein  80.31 
 
 		 127 aa  201  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0095  glycine cleavage system H protein  62.3 
 
 		 123 aa  152  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  61.6 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  60.5 
 
 		 127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2352  glycine cleavage system H protein  62.9 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0122881  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0046  glycine cleavage system H protein  57.85 
 
 		 122 aa  143  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517546  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  54.69 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6247  glycine cleavage system H protein  55.56 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.150459  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00500  glycine cleavage system H protein  54.03 
 
 		 123 aa  136  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.745408  normal  0.125042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3846  glycine cleavage system H protein  59.35 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  64.65 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0425  glycine cleavage system H protein  57.6 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  55.05 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  54.69 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  50.43 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  58.97 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  53.12 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  50.43 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  56.9 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  53.12 
 
 		 127 aa  127  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  63.73 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  57.28 
 
 		 124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  50.42 
 
 		 126 aa  124  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  53.21 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 131 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 131 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 131 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  54.7 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12390  glycine cleavage system H protein  53.85 
 
 		 123 aa  123  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00556536  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  55.08 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  53.33 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  52.5 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  52.38 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  51.18 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  56.86 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  48.67 
 
 		 135 aa  120  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  54.29 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17961  putative glycine cleavage H-protein  47.06 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  54.08 
 
 		 123 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  50.91 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  45.16 
 
 		 130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  53.45 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  54.1 
 
 		 126 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  45.16 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  54.1 
 
 		 126 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  54.1 
 
 		 126 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  54.1 
 
 		 126 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  54.1 
 
 		 126 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  45.16 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  45.16 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  54.1 
 
 		 126 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  47.54 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  51.64 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  52.46 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  45.16 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  45.16 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  46.02 
 
 		 130 aa  117  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  48.57 
 
 		 129 aa  117  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  45.9 
 
 		 129 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  50.91 
 
 		 120 aa  117  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  45.9 
 
 		 129 aa  116  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  45.9 
 
 		 129 aa  116  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  48.57 
 
 		 129 aa  116  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  45.9 
 
 		 129 aa  116  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  44.26 
 
 		 129 aa  116  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0984  glycine cleavage system H protein  51.26 
 
 		 135 aa  115  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.052829  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  51.26 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  53.06 
 
 		 123 aa  115  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  52.78 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  47.62 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0247  glycine cleavage system protein H  48.44 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  48.57 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  49.58 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  56 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  46.02 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  43.2 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>