More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6247 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6247  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 127 aa  254  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.150459  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  61.16 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0046  glycine cleavage system H protein  55.65 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517546  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  55.47 
 
 		 129 aa  141  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0095  glycine cleavage system H protein  60.33 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  57.03 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  55.56 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0536  glycine cleavage system H protein  55.56 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  54.26 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2352  glycine cleavage system H protein  56.45 
 
 		 126 aa  133  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0122881  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  51.94 
 
 		 128 aa  133  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  54.03 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  57.38 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00500  glycine cleavage system H protein  53.17 
 
 		 123 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.745408  normal  0.125042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  57.5 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  56.25 
 
 		 124 aa  126  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  56.91 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  54.87 
 
 		 134 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0425  glycine cleavage system H protein  54.03 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  53.6 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  52 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3743  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 125 aa  120  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  51.56 
 
 		 128 aa  120  7e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3846  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  51.22 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  56.25 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  50.78 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  50.78 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  46.88 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  53.57 
 
 		 131 aa  117  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  52.42 
 
 		 130 aa  117  7e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  46.15 
 
 		 130 aa  116  9e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 131 aa  116  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 131 aa  116  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 131 aa  116  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  48.33 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  47.66 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  42.86 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  47.2 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1094  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.265813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0980  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.695732  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75530  H-protein subunit of glycine cleavage system  44.72 
 
 		 177 aa  114  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  45.67 
 
 		 126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 		 129 aa  113  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  47.33 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  47.33 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  47.33 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  47.33 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  47.33 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  47.33 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  48.31 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  47.33 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  47.33 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  47.33 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  47.33 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  47.33 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  47.33 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  47.33 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  46.72 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  47.33 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0984  glycine cleavage system H protein  47.97 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.052829  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2340  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  47.5 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  45.31 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  45.31 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  50.77 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 126 aa  112  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  44.88 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  45.31 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  46.28 
 
 		 128 aa  110  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  49.61 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  45.38 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  45.38 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  46.72 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  45.38 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  45.38 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  45.38 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  47.46 
 
 		 120 aa  110  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1560  glycine cleavage system H protein  50.85 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  45.38 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  45.83 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  45.38 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  44.27 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>