More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2340 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2340  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 134 aa  265  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  61.83 
 
 		 131 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  61.83 
 
 		 131 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  61.83 
 
 		 131 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  62.02 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  62.5 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  57.36 
 
 		 131 aa  161  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  60.94 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  53.44 
 
 		 134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  55.81 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  54.41 
 
 		 134 aa  140  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  47.66 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  47.66 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  53.85 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 136 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  54.62 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  52 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  51.97 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  51.16 
 
 		 127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  51.16 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  51.16 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  49.22 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  50.78 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  47.66 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  52.67 
 
 		 134 aa  127  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  49.23 
 
 		 130 aa  126  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  46.92 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  46.92 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  49.22 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3743  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  57.84 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  49.21 
 
 		 140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  50.38 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  49.22 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  50.42 
 
 		 133 aa  124  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  47.73 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  48.85 
 
 		 129 aa  123  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  48.85 
 
 		 129 aa  123  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  48.85 
 
 		 129 aa  123  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  46.27 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  46.15 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  48.03 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  50.78 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  48.85 
 
 		 129 aa  123  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  48.09 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  44.62 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  46.03 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  48.09 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  46.46 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  48.46 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  48.09 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  52.83 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 		 135 aa  120  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  48.44 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  46.88 
 
 		 127 aa  120  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  52.88 
 
 		 124 aa  120  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  47.33 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  47.33 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  47.33 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  46.97 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  46.4 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  47.33 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  47.33 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  46.56 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  47.33 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  47.33 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  47.71 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  46.03 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  48.44 
 
 		 127 aa  117  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  45.04 
 
 		 127 aa  116  9e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  44.27 
 
 		 129 aa  116  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  43.41 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  44.96 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  45.04 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  43.41 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  46.21 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  47.24 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  46.83 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>