More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1107 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1107  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 126 aa  254  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0787  glycine cleavage system H protein  62.4 
 
 		 128 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  63.56 
 
 		 125 aa  169  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  63.71 
 
 		 127 aa  168  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  62.9 
 
 		 127 aa  165  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  63.78 
 
 		 127 aa  164  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  56.56 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  53.6 
 
 		 129 aa  143  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  55.65 
 
 		 129 aa  143  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  54.76 
 
 		 126 aa  140  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  52.46 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  56.35 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  51.22 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  56 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  56.78 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  57.63 
 
 		 129 aa  131  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  52.1 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  54.4 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  57.63 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  56 
 
 		 129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  52.76 
 
 		 127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  55.83 
 
 		 128 aa  130  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  55.83 
 
 		 128 aa  130  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  56.8 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  55.83 
 
 		 128 aa  130  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1982  glycine cleavage system H protein  50.81 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0297807  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  55.2 
 
 		 129 aa  129  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  55.2 
 
 		 129 aa  129  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  55.2 
 
 		 129 aa  129  9e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  55.2 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  55.93 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  55.2 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  55.2 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  54.46 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  54.7 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1662  glycine cleavage system protein H  54.31 
 
 		 135 aa  128  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.293907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  53.28 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  53.28 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  53.28 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  53.28 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  53.28 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  53.28 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  51.26 
 
 		 127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  53.28 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  49.61 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  54.4 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  55.37 
 
 		 129 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  55.37 
 
 		 129 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  55.37 
 
 		 129 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  53.6 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  53.72 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 		 129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  53.6 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  52.07 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  52.59 
 
 		 134 aa  125  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 		 126 aa  124  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  124  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 		 131 aa  125  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  47.11 
 
 		 135 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  53.28 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  53.28 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  51.69 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  50.42 
 
 		 125 aa  124  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 131 aa  123  7e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 131 aa  123  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 		 122 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 123 aa  123  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  46.4 
 
 		 130 aa  123  9e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0425  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  57.14 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1626  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  51.38 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0177  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 125 aa  120  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0213  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 129 aa  120  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  52.07 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>