More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0396 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0396  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 123 aa  247  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0390  glycine cleavage system H protein  99.19 
 
 		 123 aa  246  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.927773 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0338  glycine cleavage system H protein  66.67 
 
 		 125 aa  165  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0357579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0376  glycine cleavage system H protein  63.41 
 
 		 124 aa  161  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2673  glycine cleavage system H protein  62.5 
 
 		 124 aa  155  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3154  glycine cleavage system H protein  59.35 
 
 		 124 aa  154  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1591  glycine cleavage system H protein  61.67 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 123 aa  134  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1738  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000301495  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  129  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0244  glycine cleavage system H protein  54.55 
 
 		 116 aa  127  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 122 aa  127  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 123 aa  127  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  48.72 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  48.72 
 
 		 122 aa  125  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  54.17 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  48.72 
 
 		 122 aa  125  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  50.43 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 		 121 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 123 aa  124  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 		 125 aa  124  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  51.33 
 
 		 120 aa  124  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  47.41 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  47.9 
 
 		 121 aa  124  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  47.41 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  47.06 
 
 		 121 aa  123  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  46.15 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  46.15 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  48.31 
 
 		 125 aa  123  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  45.3 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  45.3 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  54.62 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  47.41 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  54.62 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 130 aa  120  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  49.58 
 
 		 125 aa  120  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  44.83 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  52.14 
 
 		 136 aa  120  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1020  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000891205  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  51.28 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  45.76 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  47.41 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  47.01 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  46.15 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  46.02 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  57.02 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  43.22 
 
 		 140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00460  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  47.5 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.528435  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  43.97 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  47.37 
 
 		 127 aa  117  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  47.41 
 
 		 121 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  48.28 
 
 		 129 aa  116  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  47.86 
 
 		 125 aa  116  9e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 130 aa  116  9e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 120 aa  116  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  55.26 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  48.21 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  46.9 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  55.26 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  55.26 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  45.61 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  45.61 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  45.61 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  45.61 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  45.61 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  54.39 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  47.06 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  45.61 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  52.54 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32847  glycine decarboxylase  44.63 
 
 		 157 aa  114  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  44.64 
 
 		 134 aa  115  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  45.61 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  49.11 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  52.21 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  43.8 
 
 		 123 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  54.39 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  45.61 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  54.39 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  54.39 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  54.39 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>