More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0338 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0338  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 125 aa  250  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0357579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0376  glycine cleavage system H protein  78.86 
 
 		 124 aa  206  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3154  glycine cleavage system H protein  70.49 
 
 		 124 aa  186  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0390  glycine cleavage system H protein  66.67 
 
 		 123 aa  165  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.927773 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2673  glycine cleavage system H protein  64.52 
 
 		 124 aa  165  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0396  glycine cleavage system H protein  66.67 
 
 		 123 aa  165  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1591  glycine cleavage system H protein  60.48 
 
 		 124 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 122 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  58.93 
 
 		 125 aa  130  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  47.86 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0244  glycine cleavage system H protein  58.88 
 
 		 116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  50.86 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  47.86 
 
 		 122 aa  124  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  48.33 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  42.74 
 
 		 135 aa  124  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 		 124 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  45.45 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  45.45 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  47.5 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1738  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 122 aa  120  9e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000301495  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  52.99 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  47.86 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  54.7 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  54.7 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  54.7 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  54.7 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 125 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  44.63 
 
 		 123 aa  116  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 121 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  49.12 
 
 		 121 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  42.98 
 
 		 127 aa  116  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  52.99 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  48.72 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  50.44 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  48.21 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  44 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  47.32 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  51.28 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  46.49 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  47.41 
 
 		 120 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  51.28 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  48.76 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  48.76 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  45.76 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  49.12 
 
 		 127 aa  114  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  49.12 
 
 		 127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  49.12 
 
 		 127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  49.12 
 
 		 127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  49.12 
 
 		 127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  47.37 
 
 		 121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  49.12 
 
 		 127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  52.99 
 
 		 129 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1020  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 120 aa  113  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000891205  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  42.74 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  52.99 
 
 		 129 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  48.72 
 
 		 129 aa  113  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  43.55 
 
 		 124 aa  113  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  49.12 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  50.44 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  49.12 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  45.83 
 
 		 123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  49.12 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  49.12 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  47.86 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  51.33 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  47.86 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  49.56 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  46.02 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  47.46 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  47.01 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  47.01 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4229  glycine cleavage system protein H  43.9 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.012135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>