More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1591 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1591  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3154  glycine cleavage system H protein  64.75 
 
 		 124 aa  168  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2673  glycine cleavage system H protein  66.13 
 
 		 124 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0338  glycine cleavage system H protein  60.48 
 
 		 125 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0357579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0376  glycine cleavage system H protein  60.66 
 
 		 124 aa  158  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0390  glycine cleavage system H protein  62.5 
 
 		 123 aa  147  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.927773 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0396  glycine cleavage system H protein  61.67 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  47.01 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  49.14 
 
 		 126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  49.14 
 
 		 126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1738  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000301495  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  45.83 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  48.33 
 
 		 127 aa  127  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  51.3 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  45.08 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  45.54 
 
 		 125 aa  123  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  46.22 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  37.9 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  46.22 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  48.33 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  45.16 
 
 		 125 aa  120  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  48.21 
 
 		 122 aa  120  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  48.21 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  45.83 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  44.17 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  41.67 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  45.3 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  44.63 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  51.28 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  46.55 
 
 		 132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  46.22 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  43.22 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 		 120 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75530  H-protein subunit of glycine cleavage system  47.15 
 
 		 177 aa  116  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 135 aa  115  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  45.08 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  44.17 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 129 aa  115  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  47.06 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 136 aa  115  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  44.17 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0244  glycine cleavage system H protein  47.27 
 
 		 116 aa  115  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  48.36 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3743  glycine cleavage system H protein  47.46 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0764  glycine cleavage system protein H  50.86 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  42.37 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  44.54 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  43.33 
 
 		 128 aa  114  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  42.98 
 
 		 128 aa  114  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  44.54 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  42.86 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  44.54 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  44.54 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  47.41 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  37.29 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  45.83 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  48.72 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00460  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  47.01 
 
 		 160 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.528435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  43.8 
 
 		 130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  46.83 
 
 		 126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  46.34 
 
 		 130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  45.53 
 
 		 130 aa  113  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  44.63 
 
 		 122 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  45.22 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  48.28 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>