More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3958 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3958  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 124 aa  247  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0639572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3146  glycine cleavage system H protein  79.84 
 
 		 124 aa  205  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1740  glycine cleavage system H protein  78.23 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1937  glycine cleavage system H protein  78.23 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  77.69 
 
 		 123 aa  194  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4327  glycine cleavage system H protein  74.8 
 
 		 124 aa  191  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  74.38 
 
 		 122 aa  181  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  71.31 
 
 		 123 aa  178  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1432  glycine cleavage system protein H  66.67 
 
 		 124 aa  172  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1560  glycine cleavage system H protein  69.92 
 
 		 124 aa  171  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  66.13 
 
 		 124 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  55.93 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  57.39 
 
 		 129 aa  140  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  55.08 
 
 		 122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  55.56 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 121 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  54.7 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2804  glycine cleavage system protein H  55.65 
 
 		 127 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0629199  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 120 aa  133  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  52.99 
 
 		 121 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  55.17 
 
 		 122 aa  133  8e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  55.17 
 
 		 122 aa  133  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32985  glycine cleavage system protein H  55.65 
 
 		 127 aa  133  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0356565  hitchhiker  0.0000202177 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  54.78 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  54.78 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  55.17 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  54.78 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  55.17 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  54.78 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  54.78 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  54.78 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  54.78 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  54.78 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  54.78 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  54.78 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  54.78 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  54.78 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  54.78 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  53.04 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  54.78 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  54.78 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  57.39 
 
 		 127 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  54.7 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  51.75 
 
 		 125 aa  131  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  56.41 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22510  hypothetical protein  52 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000276765  hitchhiker  0.0000150311 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  53.04 
 
 		 129 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  52.14 
 
 		 121 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5427  glycine cleavage system protein H  56.52 
 
 		 127 aa  129  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.801429  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  56.03 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0994  glycine cleavage system protein H  51.3 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  53.91 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  53.98 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 120 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  54.78 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  52.14 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  48.31 
 
 		 130 aa  127  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  52.17 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  51.3 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  52.14 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  48.72 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  52.14 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  55.86 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  50.86 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 		 127 aa  127  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  52.99 
 
 		 120 aa  127  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3050  glycine cleavage system protein H  53.1 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 123 aa  126  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  54.55 
 
 		 129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  52.17 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  52.17 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4229  glycine cleavage system protein H  51.3 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.012135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  51.3 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  51.75 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  51.35 
 
 		 142 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0247  glycine cleavage system protein H  56.03 
 
 		 128 aa  123  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>