More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_22510 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_22510  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  264  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000276765  hitchhiker  0.0000150311 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1740  glycine cleavage system H protein  56.1 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1937  glycine cleavage system H protein  56.1 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4327  glycine cleavage system H protein  54.47 
 
 		 124 aa  134  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  52.85 
 
 		 123 aa  132  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3146  glycine cleavage system H protein  53.17 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  49.21 
 
 		 122 aa  130  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  53.66 
 
 		 123 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1560  glycine cleavage system H protein  51.18 
 
 		 124 aa  125  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3958  glycine cleavage system H protein  52 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0639572 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1432  glycine cleavage system protein H  44.09 
 
 		 124 aa  114  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  44.35 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 		 120 aa  114  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  43.2 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  43.55 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1216  glycine cleavage system H protein  45.08 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705649 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  43.8 
 
 		 129 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  41.27 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  44.72 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  44.63 
 
 		 129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3050  glycine cleavage system protein H  42.62 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  44.63 
 
 		 129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  44.63 
 
 		 129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  43.2 
 
 		 129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  44.63 
 
 		 129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  42.74 
 
 		 120 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  45.45 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  44.26 
 
 		 129 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  43.8 
 
 		 129 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 		 129 aa  107  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 		 129 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 		 129 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  42.4 
 
 		 129 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 		 129 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 		 129 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 		 129 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 		 129 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  42.4 
 
 		 129 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 		 129 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 		 129 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 		 129 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 		 129 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 		 129 aa  106  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 		 129 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  45.08 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  41.94 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  43.8 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  41.8 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  43.8 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  43.8 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  43.8 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  41.32 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  44.35 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  40.65 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  40.32 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  39.84 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  42.98 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  42.98 
 
 		 128 aa  103  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  44.26 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  42.15 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  40 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  40.8 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4229  glycine cleavage system protein H  41.41 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.012135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  39.52 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  38.71 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0994  glycine cleavage system protein H  39.84 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  39.84 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  42.98 
 
 		 130 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  41.67 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4391  glycine cleavage system protein H  42.19 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3096  glycine cleavage system protein H  40.98 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  41.46 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  40.16 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  40.32 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  41.18 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  40.98 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  40.16 
 
 		 140 aa  100  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  42.06 
 
 		 127 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  39.02 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  40 
 
 		 134 aa  100  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2804  glycine cleavage system protein H  42.86 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0629199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  40.98 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  39.02 
 
 		 122 aa  98.6  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01656  glycine cleavage system protein H  41.6 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.671039  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  38.52 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  40.16 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0907  glycine cleavage H-protein  40.62 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  40.5 
 
 		 127 aa  98.6  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  40.16 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  39.52 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  38.4 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1026  glycine cleavage system protein H  39.06 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.946369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  39.02 
 
 		 123 aa  98.2  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  39.2 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  42.98 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 121 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>